RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483894.5

FUBP1-208, Transcript of far upstream element binding protein 1, human

TSL 2

Gene FUBP1, Length 605 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FUBP1-208	ENST00000483894	PREP	P48147	710 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	RBSN	Q9H1K0	784 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	UCN2	Q96RP3	112 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	SOX18	P35713	384 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	COG6	Q9Y2V7	657 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	FANCA	O15360	1455 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	EEA1	Q15075	1411 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	PRNP	P04156	253 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	F13B	P05160	661 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	ATP11A	P98196	1134 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	FBXL6	Q8N531	539 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	MADD	Q8WXG6	1647 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	FSCN2	O14926	492 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	FOSL1	P15407	271 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	MCM6	Q14566	821 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	SHISA5	Q8N114	240 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	FBXL18	Q96ME1	805 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	HINFP	Q9BQA5	517 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FUBP1-208	ENST00000483894	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	DBX1	A6NMT0	343 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	ATP9B	O43861	1147 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	SEC13	P55735	322 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	ATG3	Q9NT62	314 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	PAPLN	O95428	1278 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	IGFBP4	P22692	258 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	CDC27	P30260	824 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	CEP135	Q66GS9	1140 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	AFAP1	Q8N556	730 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	PLCH2	O75038	1416 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	POM121C	A8CG34	1229 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	EPHA1	P21709	976 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	SGO2	Q562F6	1265 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	HECW1	Q76N89	1606 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	RICTOR	Q6R327	1708 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	TREML1	Q86YW5	311 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	ATP10A	O60312	1499 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	FLCN	Q8NFG4	579 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	FMN1	Q68DA7	1419 aa		7.27	□□□□□ -1.24
FUBP1-208	ENST00000483894	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FUBP1-208	ENST00000483894	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FUBP1-208	ENST00000483894	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FUBP1-208	ENST00000483894	FDX2	Q6P4F2	183 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FUBP1-208	ENST00000483894	MYO19	Q96H55	970 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FUBP1-208	ENST00000483894	POM121	Q96HA1	1249 aa		7.27	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms