RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476930.1

PTPRN-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, human

TSL 3

Gene PTPRN, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRN-213	ENST00000476930	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	ZIC5	Q96T25	663 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930		F8W031	263 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	MAP2K2	P36507	400 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	LBX1	P52954	281 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	MMP14	P50281	582 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	METTL24	Q5JXM2	366 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	RGMB	Q6NW40	437 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	MOB2	Q70IA6	237 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	BCAR3	O75815	825 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	PDE8B	O95263	885 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	TNN	Q9UQP3	1299 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	AOX1	Q06278	1338 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	MEIS3	Q99687	375 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	EYA2	O00167	538 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	NOG	Q13253	232 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	FGFR2	P21802	821 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	BCAM	P50895	628 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	GRIK5	Q16478	980 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	SIL1	Q9H173	461 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRN-213	ENST00000476930	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	CAPN15	O75808	1086 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	SLC10A3	P09131	477 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	TRIM27	P14373	513 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	FKBP1B	P68106	108 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	PRKG1	Q13976	671 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	MYO1B	O43795	1136 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	CIAO1	O76071	339 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	SLC5A1	P13866	664 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	NF2	P35240	595 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	LPIN2	Q92539	896 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	CSRNP1	Q96S65	589 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	CA12	O43570	354 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	GNAI3	P08754	354 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	CRK	P46108	304 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRN-213	ENST00000476930	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.91	□□□□□ -0.18

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