RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476783.5

PTBP2-208, Transcript of polypyrimidine tract binding protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene PTBP2, Length 779 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTBP2-208	ENST00000476783	BRICD5	Q6PL45	260 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	LGR6	Q9HBX8	967 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	LILRB3	O75022	631 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	QPCT	Q16769	361 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	MSS51	Q4VC12	460 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	RETREG3	Q86VR2	466 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	NIM1K	Q8IY84	436 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	CAMTA2	O94983	1202 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	MTMR2	Q13614	643 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF516	Q92618	1163 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	SCN7A	Q01118	1682 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	TLL1	O43897	1013 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	RGS20	O76081	388 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	CSRNP1	Q96S65	589 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	SPSB2	Q99619	263 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	C6orf229	H3BNL8	230 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	USP17L8	P0C7I0	530 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	USP48	Q86UV5	1035 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	VPS33B	Q9H267	617 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	FAM177B	A6PVY3	158 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783		H7C1D1	291 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	PPIP5K2	O43314	1243 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	A1BG	P04217	495 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	CXCL9	Q07325	125 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	TNIP1	Q15025	636 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23
PTBP2-208	ENST00000476783	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	COL4A5	P29400	1685 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	POM121C	A8CG34	1229 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	DESI1	Q6ICB0	168 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF790	Q6PG37	636 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	RETREG2	Q8NC44	543 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	MRC1	P22897	1456 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	TBC1D8	O95759	1140 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	MMP16	P51512	607 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	TEF	Q10587	303 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	AOC3	Q16853	763 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	PRR7	Q8TB68	274 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	GLMN	Q92990	594 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	NYX	Q9GZU5	481 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	JUND	P17535	347 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	CRY2	Q49AN0	593 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	SNED1	Q8TER0	1413 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTBP2-208	ENST00000476783	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms