RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 COL4A1P02462 1669 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 RTL9Q8NET4 1388 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 UBE2Q2LH0YL09 131 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 CSF1RP07333 972 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 CTSWP56202 376 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 ANKRD44Q8N8A2 993 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 TTLL11Q8NHH1 800 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 VPS33BQ9H267 617 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 MYH3P11055 1940 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 EXOC6Q8TAG9 804 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 DPF2Q92785 391 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 PTPN22Q9Y2R2 807 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 EYSQ5T1H1 3165 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 AAMPQ13685 434 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC152Q4G0S7 254 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 LMBR1LQ6UX01 489 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF333Q96JL9 665 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 C1orf115Q9H7X2 142 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 LAMB1P07942 1786 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 SULF1Q8IWU6 871 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP8B2P98198 1209 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 MTX1Q13505 466 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 SUPT20HQ8NEM7 779 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 CD99L2Q8TCZ2 262 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 GREM2Q9H772 168 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 DBNDD1Q9H9R9 158 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 NEFLP07196 543 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 ITGA6P23229 1130 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 CEP85Q6P2H3 762 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 SEC31BQ9NQW1 1179 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 CHMP3Q9Y3E7 222 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 FKBP1BP68106 108 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC57Q2TAC2 916 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 MPNDQ8N594 471 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 SRGAP3O43295 1099 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 MYCP01106 439 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 GRAPQ13588 217 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 POLA2Q14181 598 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 SIRT2Q8IXJ6 389 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 SSH3Q8TE77 659 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 SHISA4Q96DD7 197 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 BBOX1O75936 387 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 RPS8P62241 208 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 Q7L0L9 218 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 SP8Q8IXZ3 490 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 SREBF2Q12772 1141 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 SCARF1Q14162 830 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 COPRSQ9NQ92 184 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 FZD1Q9UP38 647 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 PSME4Q14997 1843 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 HMMRO75330 724 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 RPS12P25398 132 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 TAF7LQ5H9L4 462 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 TMC4Q7Z404 712 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 KLHDC4Q8TBB5 520 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 RIMBP2O15034 1052 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 ECE2O60344 883 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 DOK7Q18PE1 504 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 ERICH6BQ5W0A0 696 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 SPRYD7Q5W111 196 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 IFNL1Q8IU54 200 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 MPHOSPH8Q99549 860 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 MUC3AQ02505 3323 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 EYA2O00167 538 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
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