RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468358.5

CLDN11-202, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 3

Gene CLDN11, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-202ENST00000468358 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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CLDN11-202ENST00000468358 FGFR2P21802 821 aa21.5■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 BCAMP50895 628 aa21.5■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 SCARF1Q14162 830 aa21.5■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 USP48Q86UV5 1035 aa21.5■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.5■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.49■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.49■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.49■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 CERS5Q8N5B7 392 aa21.49■■□□□ 1.03
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CLDN11-202ENST00000468358 CEP350Q5VT06 3117 aa21.49■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
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CLDN11-202ENST00000468358 KLRG1Q96E93 195 aa21.48■■□□□ 1.03
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CLDN11-202ENST00000468358 TFCP2Q12800 502 aa21.47■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.47■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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CLDN11-202ENST00000468358 MMP14P50281 582 aa21.46■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 ATP8B2P98198 1209 aa21.46■■□□□ 1.03
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CLDN11-202ENST00000468358 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.46■■□□□ 1.03
CLDN11-202ENST00000468358 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
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CLDN11-202ENST00000468358 WNT10BO00744 389 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN11-202ENST00000468358 DLK2Q6UY11 383 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN11-202ENST00000468358 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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CLDN11-202ENST00000468358 POLA2Q14181 598 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN11-202ENST00000468358 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CLDN11-202ENST00000468358 SSH3Q8TE77 659 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN11-202ENST00000468358 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN11-202ENST00000468358 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN11-202ENST00000468358 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CLDN11-202ENST00000468358 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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CLDN11-202ENST00000468358 CNTNAP1P78357 1384 aa21.4■■□□□ 1.02
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CLDN11-202ENST00000468358 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.39■■□□□ 1.02
CLDN11-202ENST00000468358 GRM1Q13255 1194 aa21.39■■□□□ 1.01
CLDN11-202ENST00000468358 CCDC102BQ68D86 513 aa21.39■■□□□ 1.01
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CLDN11-202ENST00000468358 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.39■■□□□ 1.01
CLDN11-202ENST00000468358 GRIK5Q16478 980 aa21.38■■□□□ 1.01
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CLDN11-202ENST00000468358 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.38■■□□□ 1.01
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CLDN11-202ENST00000468358 CLRN2A0PK11 232 aa21.37■■□□□ 1.01
CLDN11-202ENST00000468358 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.37■■□□□ 1.01
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CLDN11-202ENST00000468358 MAST3O60307 1309 aa21.36■■□□□ 1.01
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CLDN11-202ENST00000468358 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CLDN11-202ENST00000468358 HMMRO75330 724 aa21.35■■□□□ 1.01
CLDN11-202ENST00000468358 VEGFBP49765 207 aa21.35■■□□□ 1.01
CLDN11-202ENST00000468358 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.35■■□□□ 1.01
CLDN11-202ENST00000468358 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.35■■□□□ 1.01
CLDN11-202ENST00000468358 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CLDN11-202ENST00000468358 TEKT1Q969V4 418 aa21.35■■□□□ 1.01
CLDN11-202ENST00000468358 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.35■■□□□ 1.01
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