RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 MAPK1P28482 360 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNA1Q09470 495 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
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RABGGTB-206ENST00000467748 TCF12Q99081 682 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
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RABGGTB-206ENST00000467748 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
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RABGGTB-206ENST00000467748 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.73□□□□□ -1.17
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RABGGTB-206ENST00000467748 ACAD11Q709F0 780 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 CCNJLQ8IV13 435 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGGTB-206ENST00000467748 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-206ENST00000467748 PIP4K2BP78356 416 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 PI16Q6UXB8 463 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGGTB-206ENST00000467748 A0A096LPE4 126 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1W2PPZ6 126 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 DYRK3O43781 588 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 NEFLP07196 543 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 IKBKEQ14164 716 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGGTB-206ENST00000467748 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 DSC3Q14574 896 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.69□□□□□ -1.18
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RABGGTB-206ENST00000467748 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.68□□□□□ -1.18
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RABGGTB-206ENST00000467748 TREHO43280 583 aa7.67□□□□□ -1.18
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RABGGTB-206ENST00000467748 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 PLCB3Q01970 1234 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDH1Q08174 1060 aa7.67□□□□□ -1.18
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RABGGTB-206ENST00000467748 GSTM4Q03013 218 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 GRM2Q14416 872 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 ABCB6Q9NP58 842 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 MAPK8P45983 427 aa7.65□□□□□ -1.18
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RABGGTB-206ENST00000467748 USP26Q9BXU7 913 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF576Q9H609 170 aa7.65□□□□□ -1.18
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RABGGTB-206ENST00000467748 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.64□□□□□ -1.19
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RABGGTB-206ENST00000467748 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 ECEL1O95672 775 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 CTSBP07858 339 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 ITPKAP23677 461 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.63□□□□□ -1.19
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RABGGTB-206ENST00000467748 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 FAAP100Q0VG06 881 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 LCE1DQ5T752 114 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 BCO2Q9BYV7 579 aa7.62□□□□□ -1.19
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