RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.39■■□□□ 1.66
IMP4-209ENST00000462357 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.39■■□□□ 1.66
IMP4-209ENST00000462357 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.39■■□□□ 1.66
IMP4-209ENST00000462357 SEMA3EO15041 775 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 POTEIP0CG38 1075 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 POTEJP0CG39 1038 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.37■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.37■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.37■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 GPR108Q9NPR9 543 aa25.37■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 A0A1B0GUL7 405 aa25.36■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.36■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 MYO1BO43795 1136 aa25.35■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.35■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.35■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.35■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 TIMM10P62072 90 aa25.34■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 DLGAP5Q15398 846 aa25.34■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 SULF1Q8IWU6 871 aa25.34■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 SCARF1Q14162 830 aa25.33■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 XAGE2Q96GT9 111 aa25.33■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 MXD3Q9BW11 206 aa25.33■■□□□ 1.65
IMP4-209ENST00000462357 MAST3O60307 1309 aa25.33■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 SHTN1A0MZ66 631 aa25.32■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 ZBTB22O15209 634 aa25.32■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 AAMPQ13685 434 aa25.32■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.32■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 RAB11FIP3O75154 756 aa25.31■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 CCDC102BQ68D86 513 aa25.31■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.31■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 JAG2Q9Y219 1238 aa25.31■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.3■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 F8W031 263 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.3■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 CREBZFQ9NS37 354 aa25.3■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.3■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.3■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.29■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 PASKQ96RG2 1323 aa25.29■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 SCN9AQ15858 1988 aa25.29■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 TNNI3KQ59H18 835 aa25.28■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 CERS5Q8N5B7 392 aa25.28■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.28■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 MRIQ9BWK5 157 aa25.28■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 GGA3Q9NZ52 723 aa25.28■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.28■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 WNT10BO00744 389 aa25.27■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 USP48Q86UV5 1035 aa25.27■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.27■■□□□ 1.64
IMP4-209ENST00000462357 EGFRP00533 1210 aa25.26■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 PHKA1P46020 1223 aa25.26■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 CFAP100Q494V2 611 aa25.26■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 SLF2Q8IX21 1173 aa25.26■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 ADORA1P30542 326 aa25.25■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.25■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 TEKT1Q969V4 418 aa25.25■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 A0A1B0GUL6 1792 aa25.25■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.24■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 PSME4Q14997 1843 aa25.23■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.23■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 NF2P35240 595 aa25.23■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.23■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 CRKP46108 304 aa25.22■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 TNFAIP1Q13829 316 aa25.22■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25.21■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.21■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 IGSF3O75054 1194 aa25.21■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 SPDYE6P0CI01 402 aa25.21■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 AACSQ86V21 672 aa25.21■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.21■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.21■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 SPATA5Q8NB90 893 aa25.21■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.21■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.21■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
IMP4-209ENST00000462357 TRAF5O00463 557 aa25.2■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 RASGRF1Q13972 1273 aa25.2■■□□□ 1.62
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