RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 SIL1Q9H173 461 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 JAG2Q9Y219 1238 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 EYA2O00167 538 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 IL1R1P14778 569 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNJ4P48050 445 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE4AQ14139 1066 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 GRIK5Q16478 980 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL24Q5JXM2 366 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 CST9Q5W186 159 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXW7Q969H0 707 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF609O15014 1411 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 AOX1Q06278 1338 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-206ENST00000461017 H7C1D1 291 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 PDE8BO95263 885 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS12P25398 132 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 BCAMP50895 628 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 C20orf194Q5TEA3 1177 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 AKAP11Q9UKA4 1901 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 GNAI3P08754 354 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 MTX1Q13505 466 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 USP48Q86UV5 1035 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 COPRSQ9NQ92 184 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 ADM5C9JUS6 153 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 SRGAP3O43295 1099 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 GNAI2P04899 355 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 USP17L8P0C7I0 530 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 ADORA1P30542 326 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 TIMM10P62072 90 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 SCARF1Q14162 830 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 KLRG1Q96E93 195 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 MYH2Q9UKX2 1941 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 F8W031 263 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 WNT10BO00744 389 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 CIAO1O76071 339 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 SASH1O94885 1247 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP8B2P98198 1209 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 TFCP2Q12800 502 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 GGA3Q9NZ52 723 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 COG6Q9Y2V7 657 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 PHKA1P46020 1223 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 SSH3Q8TE77 659 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 CELF2O95319 508 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 VEGFBP49765 207 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP2B3Q16720 1220 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP100Q494V2 611 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP85Q6P2H3 762 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT26Q7Z3Y9 468 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 JMYQ8N9B5 988 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 LPIN2Q92539 896 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO3Q9UK99 471 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 CNTNAP1P78357 1384 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 AK9Q5TCS8 1911 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GUL7 405 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-206ENST00000461017 RASSF10A6NK89 507 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-206ENST00000461017 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC5A1P13866 664 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-206ENST00000461017 MVPQ14764 893 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-206ENST00000461017 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms