RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439027.1

AC011228.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC011228.1, Length 757 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC011228.1-201ENST00000439027 ZNF521Q96K83 1311 aa11.67□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 VAMP4O75379 141 aa11.67□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 OGFOD1Q8N543 542 aa11.67□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 LINS1Q8NG48 757 aa11.67□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 COA1Q9GZY4 146 aa11.67□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 METRNQ9UJH8 293 aa11.67□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 CHMP3Q9Y3E7 222 aa11.67□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.67□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 MED23Q9ULK4 1368 aa11.67□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 ZNF804BA4D1E1 1349 aa11.66□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 C7P10643 843 aa11.66□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 DACT2Q5SW24 774 aa11.66□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 CDCA7LQ96GN5 454 aa11.66□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 PLA2G12BQ9BX93 195 aa11.66□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.66□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 THSD7BQ9C0I4 1608 aa11.66□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa11.65□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 F6X3S4 739 aa11.65□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 CSF1RP07333 972 aa11.65□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 KLRK1P26718 216 aa11.65□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 CASP7P55210 303 aa11.65□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.65□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.65□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa11.65□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.65□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.65□□□□□ -0.54
AC011228.1-201ENST00000439027 UBE2Q2LH0YL09 131 aa11.64□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 TRPA1O75762 1119 aa11.64□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 GTF2IP78347 998 aa11.64□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 CHRNDQ07001 517 aa11.64□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 DGKZQ13574 1117 aa11.64□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 MCOLN1Q9GZU1 580 aa11.64□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 MYH3P11055 1940 aa11.64□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 SPEF2Q9C093 1822 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 ZNF609O15014 1411 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 TAF5LO75529 589 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 SASH1O94885 1247 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 SLC10A3P09131 477 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 FKBP1BP68106 108 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 SLFN5Q08AF3 891 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 TAF7LQ5H9L4 462 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 MOB2Q70IA6 237 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 CSRNP1Q96S65 589 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 RNF186Q9NXI6 227 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.63□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 E9PSI1 815 aa11.62□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 SNAP23O00161 211 aa11.62□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 WNT10BO00744 389 aa11.62□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 PLIN1O60240 522 aa11.62□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 NF2P35240 595 aa11.62□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 FOXO4P98177 505 aa11.62□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 BEND3Q5T5X7 828 aa11.62□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.62□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 LMBR1LQ6UX01 489 aa11.62□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 RASAL3Q86YV0 1011 aa11.62□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 SAGE1Q9NXZ1 904 aa11.62□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 MMP14P50281 582 aa11.61□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 PRKG1Q13976 671 aa11.61□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 CCDC57Q2TAC2 916 aa11.61□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 CD209Q9NNX6 404 aa11.61□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 CNNM1Q9NRU3 951 aa11.61□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 CACNA1FO60840 1977 aa11.61□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 PSME4Q14997 1843 aa11.6□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 F8W031 263 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 GRM8O00222 908 aa11.6□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 DLGAP5Q15398 846 aa11.6□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 EPHA10Q5JZY3 1008 aa11.6□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 ZNF804AQ7Z570 1209 aa11.6□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 POTEB2H3BUK9 544 aa11.59□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa11.59□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.59□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa11.59□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 JAG2Q9Y219 1238 aa11.59□□□□□ -0.55
AC011228.1-201ENST00000439027 ALDH1L1O75891 902 aa11.58□□□□□ -0.56
AC011228.1-201ENST00000439027 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
AC011228.1-201ENST00000439027 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
AC011228.1-201ENST00000439027 CERS5Q8N5B7 392 aa11.58□□□□□ -0.56
AC011228.1-201ENST00000439027 AKAP11Q9UKA4 1901 aa11.58□□□□□ -0.56
AC011228.1-201ENST00000439027 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11.57□□□□□ -0.56
AC011228.1-201ENST00000439027 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP11.57□□□□□ -0.56
AC011228.1-201ENST00000439027 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
AC011228.1-201ENST00000439027 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
AC011228.1-201ENST00000439027 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms