RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431095.5

H19-208, H19, imprinted maternally expressed transcript, human

TSL 5

Gene H19, Length 1,481 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
H19-208	ENST00000431095	POTEI	P0CG38	1075 aa		27.72	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	POTEJ	P0CG39	1038 aa		27.72	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	ADORA1	P30542	326 aa		27.72	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		27.72	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	C1QTNF8	P60827	252 aa		27.71	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	FSTL1	Q12841	308 aa		27.71	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	TNNI3K	Q59H18	835 aa		27.71	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	CCDC102B	Q68D86	513 aa		27.71	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		27.71	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		27.71	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		27.71	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	RAB11FIP3	O75154	756 aa		27.7	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	OGFOD1	Q8N543	542 aa		27.7	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	CERS5	Q8N5B7	392 aa		27.7	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.7	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	SEMA3E	O15041	775 aa		27.7	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	PHKA1	P46020	1223 aa		27.7	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		27.69	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	CHADL	Q6NUI6	762 aa		27.69	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.69	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		27.69	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		27.69	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.69	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		27.68	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		27.68	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		27.68	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		27.67	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		27.67	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		27.67	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	EGFR	P00533	1210 aa		27.66	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	DCTPP1	Q9H773	170 aa		27.66	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		27.66	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		27.66	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		27.66	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.65	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	GORAB	Q5T7V8	394 aa		27.65	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		27.65	■■■□□ 2.02
H19-208	ENST00000431095	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		27.64	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		27.64	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	RASGRF1	Q13972	1273 aa		27.63	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		27.63	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		27.62	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		27.62	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	APBB1	O00213	710 aa		27.61	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	AACS	Q86V21	672 aa		27.61	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.61	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		27.61	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095		F8W031	263 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		27.6	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		27.6	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		27.59	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	WNT10B	O00744	389 aa		27.58	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	SCARF1	Q14162	830 aa		27.58	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	MRI	Q9BWK5	157 aa		27.58	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		27.58	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.58	■■■□□ 2.01
H19-208	ENST00000431095	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	GRIK5	Q16478	980 aa		27.57	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	SPATA5	Q8NB90	893 aa		27.57	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		27.57	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		27.57	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	MCAM	P43121	646 aa		27.56	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	DLGAP5	Q15398	846 aa		27.56	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		27.56	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	MAST3	O60307	1309 aa		27.55	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	PASK	Q96RG2	1323 aa		27.55	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	CFAP100	Q494V2	611 aa		27.55	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		27.55	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	GGA3	Q9NZ52	723 aa		27.54	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		27.53	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		27.53	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	SPDYE6	P0CI01	402 aa		27.53	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	HSPA6	P17066	643 aa		27.53	■■■□□ 2
H19-208	ENST00000431095	PRDX5	P30044	214 aa		27.53	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms