RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 ARID5AQ03989 594 aa16.47■□□□□ 0.23
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PTPRU-204ENST00000428026 FEZ1Q99689 392 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRU-204ENST00000428026 RLBP1P12271 317 aa16.47■□□□□ 0.23
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PTPRU-204ENST00000428026 DHX58Q96C10 678 aa16.47■□□□□ 0.23
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PTPRU-204ENST00000428026 PPM1EQ8WY54 764 aa16.43■□□□□ 0.22
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PTPRU-204ENST00000428026 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
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PTPRU-204ENST00000428026 UBXN1Q04323 297 aa16.42■□□□□ 0.22
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PTPRU-204ENST00000428026 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.42■□□□□ 0.22
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PTPRU-204ENST00000428026 HDXQ7Z353 690 aa16.41■□□□□ 0.22
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PTPRU-204ENST00000428026 ASIC1P78348 528 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-204ENST00000428026 APOBRQ0VD83 1088 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-204ENST00000428026 ELF2Q15723 593 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-204ENST00000428026 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-204ENST00000428026 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-204ENST00000428026 PSMA7O14818 248 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-204ENST00000428026 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-204ENST00000428026 TPTE2Q6XPS3 522 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-204ENST00000428026 PPARDQ03181 441 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRU-204ENST00000428026 GRIPAP1Q4V328 841 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRU-204ENST00000428026 DNAI2Q9GZS0 605 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRU-204ENST00000428026 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.4■□□□□ 0.22
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