RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 CNTROBQ8N137 903 aa22.29■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 MXD3Q9BW11 206 aa22.29■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.29■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 BCAMP50895 628 aa22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 TFCP2Q12800 502 aa22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-201ENST00000416295 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.26■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.26■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 HMMRO75330 724 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 EGFRP00533 1210 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 CERS5Q8N5B7 392 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 JAG2Q9Y219 1238 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 A0A1B0GUL7 405 aa22.24■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.24■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 CNTNAP1P78357 1384 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 PCNTO95613 3336 aa22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 TIMM10P62072 90 aa22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 GPR108Q9NPR9 543 aa22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.22■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 SEMA3EO15041 775 aa22.21■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 ZBTB22O15209 634 aa22.21■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 ADORA1P30542 326 aa22.21■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.21■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.21■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 XAGE2Q96GT9 111 aa22.21■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.21■■□□□ 1.15
SEMA3B-201ENST00000416295 F8W031 263 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 PHKA1P46020 1223 aa22.2■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 SCARF1Q14162 830 aa22.2■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC102BQ68D86 513 aa22.2■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.2■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 GGA3Q9NZ52 723 aa22.2■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 GORABQ5T7V8 394 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 WNT10BO00744 389 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 DLGAP5Q15398 846 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 TNNI3KQ59H18 835 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 SULF1Q8IWU6 871 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 MAST3O60307 1309 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 TRAF5O00463 557 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 USP48Q86UV5 1035 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 CFAP100Q494V2 611 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.14■■□□□ 1.14
SEMA3B-201ENST00000416295 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 RASSF10A6NK89 507 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 MYO1BO43795 1136 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 RAB11FIP3O75154 756 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 SPDYE6P0CI01 402 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.136e-6■□□□□ 9
SEMA3B-201ENST00000416295 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 RASGRF1Q13972 1273 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 CRBNQ96SW2 442 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ADM5C9JUS6 153 aa22.12■■□□□ 1.13
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