RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARTNQ5T4W7 220 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIAA0319Q5VV43 1072 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLITRK4Q8IW52 837 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EXOC8Q8IYI6 725 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PHC3Q8NDX5 983 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 APPBP2Q92624 585 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IER2Q9BTL4 223 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CABP1Q9NZU7 370 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM63CQ9P1W3 806 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADH1AP07327 375 aa5.25□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GSTT1P30711 240 aa5.25□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CRKP46108 304 aa5.25□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NR5A1Q13285 461 aa5.25□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TKFCQ3LXA3 575 aa5.25□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RELL1Q8IUW5 271 aa5.25□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.25□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF280CQ8ND82 737 aa5.25□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ELP3Q9H9T3 547 aa5.25□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MINDY4BA8MYZ0 360 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EREGO14944 169 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCNQ2O43526 872 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PHACTR2O75167 634 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RASGRF1Q13972 1273 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRIN2CQ14957 1233 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 Q6ZVU0 165 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C16orf86Q6ZW13 317 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KRT26Q7Z3Y9 468 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HOMER1Q86YM7 354 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMC5Q8IY18 1101 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PMM1Q92871 262 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SUSD3Q96L08 255 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PSMD1Q99460 953 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 F6X3S4 739 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PEX14O75381 377 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ITGA6P23229 1130 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTGIRP43119 386 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GIPRP48546 466 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IDH3AP50213 366 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TBX4P57082 545 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CHMP4BP1P59074 171 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARID5BQ14865 1188 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SV2BQ7L1I2 683 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PGBD3Q8N328 593 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C1orf127Q8N9H9 656 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FEZ1Q99689 392 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRIP2Q9C0E4 1043 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UBP1Q9NZI7 540 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GABBR1Q9UBS5 961 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 USP20Q9Y2K6 914 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LEMD3Q9Y2U8 911 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A1W2PP55 124 aa5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDPK1O15530 556 aa5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EGFRP00533 1210 aa5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LMNB2Q03252 620 aa5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DDR2Q16832 855 aa5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RHBDD1Q8TEB9 315 aa5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC39A13Q96H72 371 aa5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRRC3Q9BY71 257 aa5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRR12Q9ULL5 1215 aa5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UBAP1LF5GYI3 381 aa5.21□□□□□ -1.58
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PF4P02776 101 aa5.21□□□□□ -1.58
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RLBP1P12271 317 aa5.21□□□□□ -1.58
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARSDP51689 593 aa5.21□□□□□ -1.58
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.2 ms