RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 IFFO2Q5TF58 517 aa28■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 JAK2O60674 1132 aa27.99■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 CAVIN2O95810 425 aa27.99■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.99■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 SMIM5Q71RC9 77 aa27.99■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 RGS22Q8NE09 1264 aa27.99■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 FAM200AQ8TCP9 573 aa27.99■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 RREB1Q92766 1687 aa27.99■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 CHGBP05060 677 aa27.98■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 CLSTN2Q9H4D0 955 aa27.98■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 LIG1P18858 919 aa27.97■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.97■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 SALL1Q9NSC2 1324 aa27.97■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 C4BP0C0L5 1744 aa27.97■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.96■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 TNMDQ9H2S6 317 aa27.96■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.96■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 FAM173BQ6P4H8 233 aa27.95■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 XAGE2Q96GT9 111 aa27.95■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 MYH15Q9Y2K3 1946 aa27.95■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 DACT1Q9NYF0 836 aa27.95■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 WDR19Q8NEZ3 1342 aa27.95■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 TYRO3Q06418 890 aa27.94■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 GORABQ5T7V8 394 aa27.94■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 RCOR1Q9UKL0 485 aa27.94■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 CCDC125Q86Z20 511 aa27.93■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 PIBF1Q8WXW3 757 aa27.93■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.93■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 DTNBO60941 627 aa27.93■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 CTDNEP1O95476 244 aa27.93■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 APPBP2Q92624 585 aa27.93■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 OSBP2Q969R2 916 aa27.93■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 PTPDC1A2A3K4 754 aa27.92■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 M0R2C6 588 aa27.92■■■□□ 2.06
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PMS1-205ENST00000409985 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 BAG6P46379 1132 aa27.92■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 PGBD1Q96JS3 809 aa27.92■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 MRVI1Q9Y6F6 885 aa27.92■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.92■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa27.92■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 CTAGE5O15320 804 aa27.91■■■□□ 2.06
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PMS1-205ENST00000409985 APOBRQ0VD83 1088 aa27.91■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa27.91■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 ZNF827Q17R98 1081 aa27.91■■■□□ 2.06
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PMS1-205ENST00000409985 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.91■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.91■■■□□ 2.06
PMS1-205ENST00000409985 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.89■■■□□ 2.06
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PMS1-205ENST00000409985 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 DDX11Q96FC9 970 aa27.89■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 LRRC2Q9BYS8 371 aa27.89■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP27.89■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.88■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 NLRP10Q86W26 655 aa27.88■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 BICD2Q8TD16 824 aa27.88■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.88■■■□□ 2.05
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
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PMS1-205ENST00000409985 NR1I2O75469 434 aa27.85■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.85■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 WASHC4Q2M389 1173 aa27.85■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 RPS6KA4O75676 772 aa27.84■■■□□ 2.05
PMS1-205ENST00000409985 FGAP02671 866 aa27.84■■■□□ 2.05
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