RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 TIMM10P62072 90 aa25.19■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.19■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 CERS5Q8N5B7 392 aa25.19■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.19■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 CRBNQ96SW2 442 aa25.19■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 ADORA1P30542 326 aa25.18■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.18■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.17■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
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CLDN3-201ENST00000395145 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.17■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.17■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.17■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
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CLDN3-201ENST00000395145 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.16■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 TNNI3KQ59H18 835 aa25.16■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC102BQ68D86 513 aa25.16■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 OGFOD1Q8N543 542 aa25.16■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
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CLDN3-201ENST00000395145 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.16■■□□□ 1.62
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CLDN3-201ENST00000395145 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.15■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.15■■□□□ 1.62
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CLDN3-201ENST00000395145 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
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CLDN3-201ENST00000395145 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.14■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.14■■□□□ 1.62
CLDN3-201ENST00000395145 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CLDN3-201ENST00000395145 AAMPQ13685 434 aa25.13■■□□□ 1.61
CLDN3-201ENST00000395145 RAB11FIP3O75154 756 aa25.12■■□□□ 1.61
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CLDN3-201ENST00000395145 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CLDN3-201ENST00000395145 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.12■■□□□ 1.61
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CLDN3-201ENST00000395145 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CLDN3-201ENST00000395145 CNTROBQ8N137 903 aa25.11■■□□□ 1.61
CLDN3-201ENST00000395145 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.11■■□□□ 1.61
CLDN3-201ENST00000395145 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.11■■□□□ 1.61
CLDN3-201ENST00000395145 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.11■■□□□ 1.61
CLDN3-201ENST00000395145 HSPA6P17066 643 aa25.1■■□□□ 1.61
CLDN3-201ENST00000395145 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.1■■□□□ 1.61
CLDN3-201ENST00000395145 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.1■■□□□ 1.61
CLDN3-201ENST00000395145 PASKQ96RG2 1323 aa25.1■■□□□ 1.61
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CLDN3-201ENST00000395145 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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CLDN3-201ENST00000395145 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.06■■□□□ 1.6
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CLDN3-201ENST00000395145 DCTPP1Q9H773 170 aa25.06■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 GGA3Q9NZ52 723 aa25.06■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.06■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.06■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.06■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.05■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.05■■□□□ 1.6
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CLDN3-201ENST00000395145 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.05■■□□□ 1.6
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CLDN3-201ENST00000395145 APLP1P51693 650 aa25.04■■□□□ 1.6
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CLDN3-201ENST00000395145 CFAP100Q494V2 611 aa25.04■■□□□ 1.6
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CLDN3-201ENST00000395145 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.04■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.03■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 SPDYE6P0CI01 402 aa25.03■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.03■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.03■■□□□ 1.6
CLDN3-201ENST00000395145 MCAMP43121 646 aa25.02■■□□□ 1.6
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