RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 UNCXA6NJT0 531 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYO1BO43795 1136 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 GCC1Q96CN9 775 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM17Q9Y577 477 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF521Q96K83 1311 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 CASP7P55210 303 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 CERS5Q8N5B7 392 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 WNK4Q96J92 1243 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 FLIIQ13045 1269 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 LINS1Q8NG48 757 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPEF2Q9C093 1822 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 F8W031 263 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 VAMP4O75379 141 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAF5LO75529 589 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 CFAP100Q494V2 611 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERO1AQ96HE7 468 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYH3P11055 1940 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC3-204ENST00000373166 CACNA1FO60840 1977 aa24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLRN2A0PK11 232 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNAP23O00161 211 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPDYE6P0CI01 402 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL1R1P14778 569 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 VEZTQ9HBM0 779 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 HTTP42858 3142 aa24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 POTEFA5A3E0 1075 aa24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 E9PSI1 815 aa24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 RASA3Q14644 834 aa24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 FOXO4P98177 505 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 CRHR2Q13324 411 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 EFCC1Q9HA90 598 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3-204ENST00000373166 JAG2Q9Y219 1238 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 GJA5P36382 358 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 SP3Q02447 781 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNFAIP1Q13829 316 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLIN1O60240 522 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 MIER1Q8N108 512 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARMC5Q96C12 935 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPN18Q99952 460 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 AOX1Q06278 1338 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 CENPFP49454 3210 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLFN5Q08AF3 891 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 OPTNQ96CV9 577 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 ELP3Q9H9T3 547 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARHGEF6Q15052 776 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3-204ENST00000373166 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3-204ENST00000373166 BEND3Q5T5X7 828 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3-204ENST00000373166 F6X3S4 739 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3-204ENST00000373166 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3-204ENST00000373166 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3-204ENST00000373166 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3-204ENST00000373166 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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