RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365415.1

RNU6-117P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 117, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-117P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-117P-201ENST00000365415 AEBP1Q8IUX7 1158 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 KLHL23Q8NBE8 558 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 RUSC1Q9BVN2 902 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 ADAM19Q9H013 955 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 KCNF1Q9H3M0 494 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 A0A096LPE4 126 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 A0A1W2PPZ6 126 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 GAS2O43903 313 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 MAPK8P45983 427 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 PCDH1Q08174 1060 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 FDX2Q6P4F2 183 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 VN1R5Q7Z5H4 357 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 GALNT12Q8IXK2 581 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 DCTN4Q9UJW0 460 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 SOX13Q9UN79 622 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 ITGB7P26010 798 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 RXRBP28702 533 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 GRIA4P48058 902 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 PI16Q6UXB8 463 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 TMC7Q7Z402 723 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 CCDC74AQ96AQ1 378 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 CSRNP1Q96S65 589 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 FAM129BQ96TA1 746 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 CEP41Q9BYV8 373 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 OSGEPQ9NPF4 335 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 NLRP2Q9NX02 1062 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-117P-201ENST00000365415 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 DHX15O43143 795 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 H2AFB1P0C5Y9 115 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 H2AFB2P0C5Z0 115 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 BMP3P12645 472 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 FCGRTP55899 365 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 PLCB3Q01970 1234 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 PDE3AQ14432 1141 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 NUTM2GQ5VZR2 741 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 PRR23CQ6ZRP0 262 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 CCNJLQ8IV13 435 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 TMEM130Q8N3G9 435 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 WNT8BQ93098 351 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 DMRTB1Q96MA1 342 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 CITED4Q96RK1 184 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 TCF12Q99081 682 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 RNF208Q9H0X6 261 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 RAD18Q9NS91 495 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 STOML1Q9UBI4 398 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 DRD2P14416 443 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 FSTP19883 344 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 MAOBP27338 520 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 PREPP48147 710 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 USP11P51784 963 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 KCNA1Q09470 495 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 ZNF423Q2M1K9 1284 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 AKAP4Q5JQC9 854 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 DTHD1Q6ZMT9 781 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 Q8N3U1 123 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 SETDB2Q96T68 719 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 CORO1BQ9BR76 489 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 RBCK1Q9BYM8 510 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 AKAP2Q9Y2D5 859 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 RAXQ9Y2V3 346 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 HMX2A2RU54 273 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 ECEL1O95672 775 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 DLGAP3O95886 979 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 RAB6AP20340 208 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 GRM2Q14416 872 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 POU4F3Q15319 338 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 NFKBIBQ15653 356 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 SGO2Q562F6 1265 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 KIAA0319Q5VV43 1072 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 ANKRD34AQ69YU3 496 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 BEND4Q6ZU67 534 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 TRIM42Q8IWZ5 723 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 ARMC10Q8N2F6 343 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 FBXL6Q8N531 539 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 DNAJC25Q9H1X3 360 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 ZNF576Q9H609 170 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 C7orf69Q9H7B7 122 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-117P-201ENST00000365415 CYP4F12Q9HCS2 524 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms