RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BMP15O95972 392 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 POLD1P28340 1107 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LTBRP36941 435 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DAB2P98082 770 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PTK7Q13308 1070 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RHBDD2Q6NTF9 364 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRR23CQ6ZRP0 262 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MRGPRGQ86SM5 289 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF516Q92618 1163 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM83CQ9BQN1 747 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EGLN1Q9GZT9 426 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RETNQ9HD89 108 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRDM9Q9NQV7 894 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MBIPQ9NS73 344 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LPAP08519 4548 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SOWAHBA6NEL2 793 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A6NHS1 94 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 B4E1Z4 1266 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARVCFO00192 962 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 WNT10BO00744 389 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C1SP09871 688 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MED14OSP0DP75 135 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MCM7P33993 719 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF81P51508 661 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 POU5F1BQ06416 359 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FOXF2Q12947 444 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GAS6Q14393 721 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 WFDC3Q8IUB2 231 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LYG1Q8N1E2 194 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CHST13Q8NET6 341 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LOXL4Q96JB6 756 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MTRQ99707 1265 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PLVAPQ9BX97 442 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC39Q9UFE4 941 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARID1AO14497 2285 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SDK1Q7Z5N4 2213 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A0G2JLM5 398 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TAF4O00268 1085 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GRID2O43424 1007 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGKV1D-16P01601 117 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGKV2-30P06310 120 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NOS3P29474 1203 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TLE4Q04727 773 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNH2Q12809 1159 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DUSP4Q13115 394 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MBTPS1Q14703 1052 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CHRNA2Q15822 529 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UBXN11Q5T124 520 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRT39Q6A163 491 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF343Q6P1L6 599 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LRFN4Q6PJG9 635 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRR23BQ6ZRT6 265 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LDLRAD3Q86YD5 345 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SFTPA2Q8IWL1 248 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TTC9BQ8N6N2 239 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANKLE1Q8NAG6 615 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNH8Q96L42 1107 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARXQ96QS3 562 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NBPF3Q9H094 633 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SEMA3GQ9NS98 782 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF229Q9UJW7 825 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MMACHCQ9Y4U1 282 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF462Q96JM2 2506 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TPRP12270 2363 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SPDYE3A6NKU9 549 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LINC01565O15544 149 aa-1.26□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms