RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMK4Q16566 473 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP2B3Q16720 1220 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP7D2Q96T17 732 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 TYRO3Q06418 890 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 PGBD1Q96JS3 809 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 LRP6O75581 1613 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 WASHC4Q2M389 1173 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 CHST3Q7LGC8 479 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX11Q96FC9 970 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 TNMDQ9H2S6 317 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE8AO60658 829 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 VPS72Q15906 364 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 H3BQV1 296 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 IFFO2Q5TF58 517 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 FGD1P98174 961 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC51AQ86UW1 340 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 MAST3O60307 1309 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 M0R2C6 588 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 PHKA1P46020 1223 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 PLCB2Q00722 1185 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 OSBP2Q969R2 916 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 CTDNEP1O95476 244 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 MCAMP43121 646 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 E7EWF7 191 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 HAND2P61296 217 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 NR1I2O75469 434 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 APOBRQ0VD83 1088 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 CFAP45Q9UL16 551 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 NUP98P52948 1817 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 ERFEQ4G0M1 354 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 GNPATO15228 680 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 BICD2Q8TD16 824 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 TPM3P06753 285 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 LUZP1Q86V48 1076 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 CBX8Q9HC52 389 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO3Q9UK99 471 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE8BO95263 885 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 WNK3Q9BYP7 1800 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 NTSR2O95665 410 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXL16Q8N461 479 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 VGLL2Q8N8G2 317 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNF1Q9H3M0 494 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 AFF2P51816 1311 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC102BQ68D86 513 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF3AQ9Y496 699 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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