RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336180.6

LIMK1-201, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMK1, Length 3,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-201ENST00000336180 BARGINQ6ZT62 677 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 IL17RAQ96F46 866 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 TOMM22Q9NS69 142 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 TCHHQ07283 1943 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 SENP2Q9HC62 589 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 MYL10Q9BUA6 226 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 TAF1P21675 1872 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 NUP98P52948 1817 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 UTRNP46939 3433 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 PDE6AP16499 860 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 MRE11P49959 708 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 VPS72Q15906 364 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 SPATA5Q8NB90 893 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 APPBP2Q92624 585 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 MBD4O95243 580 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 SLC5A1P13866 664 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 LPIN2Q92539 896 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 ABCC12Q96J65 1359 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 AFF2P51816 1311 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 CAMK4Q16566 473 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 H3BQV1 296 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 ADD2P35612 726 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 IFFO2Q5TF58 517 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 GTF3C6Q969F1 213 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 AIDAQ96BJ3 306 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 B4E1Z4 1266 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 ZPR1O75312 459 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 EVX2Q03828 476 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 KRT32Q14532 448 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 ZNF213O14771 459 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 PRC1O43663 620 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 CTDNEP1O95476 244 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 NBPF3Q9H094 633 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 PLCB2Q00722 1185 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 VPS37DQ86XT2 251 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 RAI14Q9P0K7 980 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 FGFR2P21802 821 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 ANKRD1Q15327 319 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 TTC6Q86TZ1 520 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 LCORLQ8N3X6 602 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 SETDB2Q96T68 719 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 JCADQ9P266 1359 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 AIFM3Q96NN9 605 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 ANTXR2P58335 489 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 PARP10Q53GL7 1025 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 NRAPQ86VF7 1730 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LIMK1-201ENST00000336180 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms