RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318066.6

UBE2N-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 N, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2N, Length 5,186 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2N-201ENST00000318066 B4DLN1 442 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 CFAP58Q5T655 872 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 CPLX4Q7Z7G2 160 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 MXRA7P84157 204 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 SETDB1Q15047 1291 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC110Q8TBZ0 833 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 IFNKQ9P0W0 207 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 STIM2Q9P246 746 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 GRIN2AQ12879 1464 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 UBXN1Q04323 297 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 ZBTB16Q05516 673 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 USP26Q9BXU7 913 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 CHMLP26374 656 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 DAAM2Q86T65 1068 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 PTGS1P23219 599 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC26Q8TAB7 109 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 CALCOCO2Q13137 446 aa21.45■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 COPS6Q7L5N1 327 aa21.45■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.45■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
UBE2N-201ENST00000318066 PHACTR2O75167 634 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 VAMP4O75379 141 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
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UBE2N-201ENST00000318066 PLCD1P51178 756 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 CSRNP2Q9H175 543 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 VPS18Q9P253 973 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 GUCA1BQ9UMX6 200 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 ST5P78524 1137 aa21.43■■□□□ 1.02
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UBE2N-201ENST00000318066 CCDC114Q96M63 670 aa21.43■■□□□ 1.02
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UBE2N-201ENST00000318066 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 MAP3K9P80192 1104 aa21.42■■□□□ 1.02
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UBE2N-201ENST00000318066 FLT4P35916 1363 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 ATP2C2O75185 946 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 CLUL1Q15846 466 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 PPFIBP2Q8ND30 876 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 NLRP3Q96P20 1036 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 TMEM87BQ96K49 555 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC14Q49A88 953 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 GSTA5Q7RTV2 222 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.41■■□□□ 1.02
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UBE2N-201ENST00000318066 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 FAM13AO94988 1023 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF445P59923 1031 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 NUP58Q9BVL2 599 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 RASSF4Q9H2L5 321 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 PPP2R5BQ15173 497 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 NBPF4Q96M43 638 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 SWAP70Q9UH65 585 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 STK24Q9Y6E0 443 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 IQCDQ96DY2 449 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 WDR78Q5VTH9 848 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 SELENOSQ9BQE4 189 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 EVCP57679 992 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC65Q8IXS2 484 aa21.4■■□□□ 1.02
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