RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299194.5

LRTM2-201, Transcript of leucine rich repeats and transmembrane domains 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRTM2, Length 3,688 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTM2-201ENST00000299194 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 NALCNQ8IZF0 1738 aa15.12■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 CTDNEP1O95476 244 aa15.12■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 KCNB2Q92953 911 aa15.12■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 STX1AQ16623 288 aa15.11■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa15.11■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 IGSF3O75054 1194 aa15.11■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 TDO2P48775 406 aa15.11■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 PDILTQ8N807 584 aa15.11■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 FUCA2Q9BTY2 467 aa15.11■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 ALG1Q9BT22 464 aa15.11■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 DSCC1Q9BVC3 393 aa15.11■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 NAPBQ9H115 298 aa15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 ANO10Q9NW15 660 aa15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 PCDHA7Q9UN72 937 aa15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 NFAT5O94916 1531 aa15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 PHKA1P46020 1223 aa15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 CTDSPL2Q05D32 466 aa15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 BRINP3Q76B58 766 aa15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 PIGBQ92521 554 aa15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 TMX1Q9H3N1 280 aa15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 LRP2BPQ9P2M1 347 aa15.1■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 LTN1O94822 1766 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 SPTLC2O15270 562 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 TPM3P06753 285 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 NDUFA8P51970 172 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM67Q5HYA8 995 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 HOMER1Q86YM7 354 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 KIAA1524Q8TCG1 905 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 SKILP12757 684 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 TMC6Q7Z403 805 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 SLAIN2Q9P270 581 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa15.09■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa15.08■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.08■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 CASP7P55210 303 aa15.08■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 CCDC144BQ3MJ40 725 aa15.08■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.08■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 MAGEB6Q8N7X4 407 aa15.08■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.08■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 APPBP2Q92624 585 aa15.08■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.08■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 ELP1O95163 1332 aa15.08■□□□□ 0.01
LRTM2-201ENST00000299194 CCDC69A6NI79 296 aa15.08■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.08■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 VPS37DQ86XT2 251 aa15.08■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 IL17RAQ96F46 866 aa15.08■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 ARMT1Q9H993 441 aa15.08■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF532Q9HCE3 1301 aa15.08■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 FAM160A1Q05DH4 1040 aa15.08■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.08■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 JAG2Q9Y219 1238 aa15.08■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.08■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 TPM4P67936 248 aa15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 ZBTB9Q96C00 473 aa15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 SERPINC1P01008 464 aa15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 MCAMP43121 646 aa15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 KCNQ4P56696 695 aa15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 PDCL2Q8N4E4 241 aa15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 IFNKQ9P0W0 207 aa15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 SH3TC1Q8TE82 1336 aa15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.07■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 MBD4O95243 580 aa15.06■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 CLIC6Q96NY7 704 aa15.06■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 BCL2L12Q9HB09 334 aa15.06■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 SENP2Q9HC62 589 aa15.06■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 RAI14Q9P0K7 980 aa15.06■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 TSGA10IPQ3SY00 556 aa15.06■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.06■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.06■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 ZBTB43O43298 467 aa15.05■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.05■□□□□ 0
LRTM2-201ENST00000299194 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms