RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 PROM2Q8N271 834 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 DTNBO60941 627 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 TM4SF1P30408 202 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 GYG1P46976 350 aa27.09■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 GYS1P13807 737 aa27.08■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 UBE4AQ14139 1066 aa27.08■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1B0GUL6 1792 aa27.08■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 E7EWF7 191 aa27.08■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 FGAP02671 866 aa27.08■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 TXNRD1Q16881 649 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 MCTP1Q6DN14 999 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 Q6ZUG5 572 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 CNBD1Q8NA66 436 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 CHAMP1Q96JM3 812 aa27.07■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF804BA4D1E1 1349 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K12Q12852 859 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEB6Q8N7X4 407 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC2Q9BYS8 371 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 CTNNA3Q9UI47 895 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA6L22H0YM25 854 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 HAND2P61296 217 aa27.05■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.04■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 GJB2P29033 226 aa27.03■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 KLRK1P26718 216 aa27.02■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 CAVIN4Q5BKX8 364 aa27.02■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 STK3Q13188 491 aa27.02■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 DOCK2Q92608 1830 aa27.02■■□□□ 1.92
VSTM4-201ENST00000298454 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 AIDAQ96BJ3 306 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 LAMA4Q16363 1823 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 PTMSP20962 102 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 SYT1P21579 422 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 VPS37DQ86XT2 251 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 BRF1Q92994 677 aa27.01■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 SLC51AQ86UW1 340 aa27■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD2Q9GZV1 360 aa27■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 LRP2BPQ9P2M1 347 aa27■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINB2P05120 415 aa26.99■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 CHST3Q7LGC8 479 aa26.99■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 APPP05067 770 aa26.99■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 FGD1P98174 961 aa26.99■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF213O14771 459 aa26.98■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 STX6O43752 255 aa26.98■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 MBD4O95243 580 aa26.98■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 APBA3O96018 575 aa26.98■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 GRAPQ13588 217 aa26.98■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 ABCF2Q9UG63 623 aa26.98■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.97■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 ARMT1Q9H993 441 aa26.97■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.97■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF827Q17R98 1081 aa26.97■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 LMBRD1Q9NUN5 540 aa26.97■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 DDR1Q08345 913 aa26.96■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.96■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 PLSCR1O15162 318 aa26.95■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 RXRBP28702 533 aa26.95■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 GTF3C6Q969F1 213 aa26.95■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF3Q9H094 633 aa26.95■■□□□ 1.91
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 ST5P78524 1137 aa26.95■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.95■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 APOBRQ0VD83 1088 aa26.94■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.94■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 LCORLQ8N3X6 602 aa26.94■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 RAI14Q9P0K7 980 aa26.94■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRA1Q86SQ6 560 aa26.93■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 MIGA1Q8NAN2 632 aa26.93■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 CRY2Q49AN0 593 aa26.92■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 CYP7A1P22680 504 aa26.92■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 SCRN1Q12765 414 aa26.92■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.92■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 IFNL3Q8IZI9 196 aa26.92■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 NCOA7Q8NI08 942 aa26.92■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 165.5 ms