RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA0825Q8IV33 1275 aa30.96■■■□□ 2.55
CXCL2-201ENST00000296031 CERS5Q8N5B7 392 aa30.96■■■□□ 2.55
CXCL2-201ENST00000296031 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
CXCL2-201ENST00000296031 MMP14P50281 582 aa30.95■■■□□ 2.55
CXCL2-201ENST00000296031 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
CXCL2-201ENST00000296031 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP30.95■■■□□ 2.55
CXCL2-201ENST00000296031 FAM205AQ6ZU69 1335 aa30.95■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 TFCP2Q12800 502 aa30.94■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 CEP85Q6P2H3 762 aa30.94■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.94■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 MYH13Q9UKX3 1938 aa30.93■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 HDAC9Q9UKV0 1011 aa30.93■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 ARAP2Q8WZ64 1704 aa30.93■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 TRAF5O00463 557 aa30.92■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP30.92■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 AKAP2Q9Y2D5 859 aa30.92■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 F8W031 263 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 SCARF1Q14162 830 aa30.91■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 GGA3Q9NZ52 723 aa30.91■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 TRPM7Q96QT4 1865 aa30.91■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 SURF6O75683 361 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 MFSD14BQ5SR56 506 aa30.9■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 CDC37L1Q7L3B6 337 aa30.9■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 TIMM10P62072 90 aa30.89■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 CREBZFQ9NS37 354 aa30.89■■■□□ 2.54
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM88BA6NKF7 163 aa30.88■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 ADORA1P30542 326 aa30.88■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 USP48Q86UV5 1035 aa30.88■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1B0GUL7 405 aa30.87■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 NBPF9Q3BBW0 867 aa30.87■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 KRT26Q7Z3Y9 468 aa30.87■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 PHKA1P46020 1223 aa30.85■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa30.85■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa30.85■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 ADM5C9JUS6 153 aa30.84■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 WNT10BO00744 389 aa30.84■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 NEUROD6Q96NK8 337 aa30.84■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 DLGAP5Q15398 846 aa30.83■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC102BQ68D86 513 aa30.83■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 DLK2Q6UY11 383 aa30.83■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 SULF1Q8IWU6 871 aa30.83■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 XAGE2Q96GT9 111 aa30.83■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.53
CXCL2-201ENST00000296031 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF408Q9H9D4 720 aa30.82■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa30.81■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 CELF2O95319 508 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 GRIK5Q16478 980 aa30.81■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 CFAP100Q494V2 611 aa30.81■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 MTMR14Q8NCE2 650 aa30.81■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 GPR108Q9NPR9 543 aa30.81■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 SEMA3EO15041 775 aa30.8■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 HMMRO75330 724 aa30.8■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP30.8■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 CST9Q5W186 159 aa30.8■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 SIRT2Q8IXJ6 389 aa30.8■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 WDR66Q8TBY9 1149 aa30.8■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa30.8■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 ECM29Q5VYK3 1845 aa30.8■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB22O15209 634 aa30.79■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 KLRG1Q96E93 195 aa30.79■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 DENND2AQ9ULE3 1009 aa30.79■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa30.79■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 GORABQ5T7V8 394 aa30.78■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 SERPINA10Q9UK55 444 aa30.78■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 TNNI3KQ59H18 835 aa30.77■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa30.77■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa30.77■■■□□ 2.52
CXCL2-201ENST00000296031 SPDYE2BA6NHP3 402 aa30.76■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 SPDYE6P0CI01 402 aa30.76■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa30.76■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 ERC1Q8IUD2 1116 aa30.76■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 CRKP46108 304 aa30.74■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 RASGRF1Q13972 1273 aa30.74■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 CDCA5Q96FF9 252 aa30.74■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 MYO1BO43795 1136 aa30.73■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 CNTNAP1P78357 1384 aa30.73■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 MAST3O60307 1309 aa30.73■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 AOX1Q06278 1338 aa30.73■■■□□ 2.51
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