RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264244.7

TIMMDC1-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMMDC1, Length 1,271 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-201ENST00000264244 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 CERS5Q8N5B7 392 aa16■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF853P0CG23 659 aa15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 NBPF11Q86T75 865 aa15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 CD209Q9NNX6 404 aa15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPEF2Q9C093 1822 aa15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 CLRN2A0PK11 232 aa15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 ANKRD2Q9GZV1 360 aa15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 AOX1Q06278 1338 aa15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 MYO1BO43795 1136 aa15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPDYE6P0CI01 402 aa15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 RASA3Q14644 834 aa15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 RALBP1Q15311 655 aa15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 CFAP100Q494V2 611 aa15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 C8orf58Q8NAV2 365 aa15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 OPTNQ96CV9 577 aa15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 VEZTQ9HBM0 779 aa15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 CEP290O15078 2479 aa15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 IRS2Q9Y4H2 1338 aa15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 LAMA3Q16787 3333 aa15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 F8W031 263 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 SNAP23O00161 211 aa15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 ARHGEF6Q15052 776 aa15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 KSR2Q6VAB6 950 aa15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 BRI3BPQ8WY22 251 aa15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 ELP3Q9H9T3 547 aa15.95■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 H7C1W4 665 aa15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 ITGA6P23229 1130 aa15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 KCNJ4P48050 445 aa15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 CHRNDQ07001 517 aa15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 MPHOSPH8Q99549 860 aa15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 IFT57Q9NWB7 429 aa15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 MYH3P11055 1940 aa15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 CCDC30Q5VVM6 783 aa15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 ECM29Q5VYK3 1845 aa15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 IL1R1P14778 569 aa15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 GNAI1P63096 354 aa15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 CCL15Q16663 113 aa15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 PLA2G12BQ9BX93 195 aa15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 DLL1O00548 723 aa15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 TAF5LO75529 589 aa15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 CSF1RP07333 972 aa15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 GTF2A2P52657 109 aa15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 JAG2Q9Y219 1238 aa15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 OTOFQ9HC10 1997 aa15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 VGLL4Q14135 290 aa15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 TSPYL6Q8N831 410 aa15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 SHISA4Q96DD7 197 aa15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 TEPSINQ96N21 525 aa15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 CASP7P55210 303 aa15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1-201ENST00000264244 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1-201ENST00000264244 TNFAIP1Q13829 316 aa15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1-201ENST00000264244 GCKRQ14397 625 aa15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1-201ENST00000264244 DPF3Q92784 378 aa15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1-201ENST00000264244 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1-201ENST00000264244 TLR2O60603 784 aa15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1-201ENST00000264244 MAP3K9P80192 1104 aa15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1-201ENST00000264244 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93 ms