RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.05■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 BCAMP50895 628 aa26.04■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 GMLQ99445 158 aa26.04■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 ADORA1P30542 326 aa26.03■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.03■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 MICALL2Q8IY33 904 aa26.03■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 DPF2Q92785 391 aa26.03■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 JAG2Q9Y219 1238 aa26.03■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.03■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 PCNTO95613 3336 aa26.03■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.02■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 TNS4Q8IZW8 715 aa26.02■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.02■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
COX5B-201ENST00000258424 A0A1B0GUL7 405 aa26.01■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 RASSF10A6NK89 507 aa26.01■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 TIMM10P62072 90 aa26.01■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 VPS37DQ86XT2 251 aa26.01■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 CERS5Q8N5B7 392 aa26.01■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 HMMRO75330 724 aa26■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 TRPM4Q8TD43 1214 aa26■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 EGFRP00533 1210 aa25.98■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 PHKA1P46020 1223 aa25.98■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.98■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.97■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 TRAF5O00463 557 aa25.97■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 TNNI3KQ59H18 835 aa25.97■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.97■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 XAGE2Q96GT9 111 aa25.97■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.97■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 H7C1D1 291 aa25.96■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 FOXN1O15353 648 aa25.96■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 AIDAQ96BJ3 306 aa25.96■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.96■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 GPR108Q9NPR9 543 aa25.96■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.96■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
COX5B-201ENST00000258424 USP17L8P0C7I0 530 aa25.95■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 CST9Q5W186 159 aa25.95■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 CCDC102BQ68D86 513 aa25.95■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.94■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 WBP1LQ9NX94 342 aa25.94■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.93■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.93■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.93■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.93■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 APBB1O00213 710 aa25.92■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.92■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.92■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 F8W031 263 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 ECE1P42892 770 aa25.91■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 GRIK5Q16478 980 aa25.91■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.91■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.91■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.91■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.91■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 RASGRF1Q13972 1273 aa25.9■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.9■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.9■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 CAPNS2Q96L46 248 aa25.89■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.89■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
COX5B-201ENST00000258424 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
COX5B-201ENST00000258424 SEMA3EO15041 775 aa25.88■■□□□ 1.73
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB22O15209 634 aa25.88■■□□□ 1.73
COX5B-201ENST00000258424 RAB11FIP3O75154 756 aa25.88■■□□□ 1.73
COX5B-201ENST00000258424 CAPN15O75808 1086 aa25.88■■□□□ 1.73
COX5B-201ENST00000258424 GORABQ5T7V8 394 aa25.88■■□□□ 1.73
COX5B-201ENST00000258424 OGFOD1Q8N543 542 aa25.88■■□□□ 1.73
COX5B-201ENST00000258424 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.88■■□□□ 1.73
COX5B-201ENST00000258424 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.88■■□□□ 1.73
COX5B-201ENST00000258424 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms