RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.1■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 ZBTB43O43298 467 aa18.1■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 ZNF853P0CG23 659 aa18.1■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 SNCBQ16143 134 aa18.1■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 MYD88Q99836 296 aa18.1■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 VCX3BQ9H321 246 aa18.1■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 NSD2O96028 1365 aa18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 CAPS2Q9BXY5 557 aa18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 GBP5Q96PP8 586 aa18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 ABCF2Q9UG63 623 aa18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 ETF1P62495 437 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 ATP8B2P98198 1209 aa18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 TBC1D5Q92609 795 aa18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 ATP2A1O14983 1001 aa18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 ICE2Q659A1 982 aa18.09■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 CCDC25Q86WR0 208 aa18.08■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 VSIG1Q86XK7 387 aa18.08■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 PAK2Q13177 524 aa18.08■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.08■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 GPT2Q8TD30 523 aa18.08■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.08■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 TERF2Q15554 542 aa18.08■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 E2F4Q16254 413 aa18.08■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 CEP120Q8N960 986 aa18.08■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA8KD6RF30 607 aa18.08■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 CEP85Q6P2H3 762 aa18.08■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 ZNF365Q70YC5 407 aa18.08■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 JAKMIP2Q96AA8 810 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 TBC1D31Q96DN5 1066 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 ARID5AQ03989 594 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 LRRC8AQ8IWT6 810 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 CCDC110Q8TBZ0 833 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 ANAPC4Q9UJX5 808 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 IFT140Q96RY7 1462 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 CCT5P48643 541 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 ESCO1Q5FWF5 840 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 BICDL2A1A5D9 508 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 FRMD3A2A2Y4 597 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 AFAP1Q8N556 730 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa18.07■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 NLRP12P59046 1061 aa18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 CALCOCO2Q13137 446 aa18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 CEP128Q6ZU80 1094 aa18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 PIK3R4Q99570 1358 aa18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 TRIM75PA6NK02 468 aa18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 ZNF287Q9HBT7 754 aa18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 CCDC174Q6PII3 467 aa18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R7Q15435 360 aa18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 ODF2LQ9ULJ1 636 aa18.06■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 MCTP2Q6DN12 878 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 SEPT14Q6ZU15 432 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 CROCCP2Q86T23 111 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 ASIC1P78348 528 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 TSNARE1Q96NA8 513 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 MKNK2Q9HBH9 465 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 MFSD6Q6ZSS7 791 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 EXOC4Q96A65 974 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 HIP1RO75146 1068 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 MTX1Q13505 466 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 MCUR1Q96AQ8 359 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 TRIM4Q9C037 500 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 APOBRQ0VD83 1088 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 MAP7Q14244 749 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 GRIN2BQ13224 1484 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 TOM1O60784 492 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 CPA1P15085 419 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 CETN3O15182 167 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 TRIM68Q6AZZ1 485 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 FYB2Q5VWT5 728 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 CCDC170Q8IYT3 715 aa18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms