RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 CCDC69A6NI79 296 aa21.45■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 SPTLC2O15270 562 aa21.45■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.45■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 DMTNQ08495 405 aa21.45■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 CEP135Q66GS9 1140 aa21.45■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 GPAA1O43292 621 aa21.44■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 CLIC4Q9Y696 253 aa21.44■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 CTDNEP1O95476 244 aa21.44■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 TMC6Q7Z403 805 aa21.44■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 SYNE4Q8N205 404 aa21.44■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 AIDAQ96BJ3 306 aa21.44■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 NFAT5O94916 1531 aa21.44■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.44■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 STARD3NLO95772 234 aa21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 TMEM94Q12767 1356 aa21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 SERPINC1P01008 464 aa21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 IL2RBP14784 551 aa21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 NDUFA8P51970 172 aa21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 ALG1Q9BT22 464 aa21.42■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 LRRC37A3O60309 1634 aa21.42■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 HSPA2P54652 639 aa21.42■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.42■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 LTN1O94822 1766 aa21.42■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.41■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 SCARF1Q14162 830 aa21.41■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 PHKBQ93100 1093 aa21.41■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 MYL10Q9BUA6 226 aa21.41■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.41■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 APPBP2Q92624 585 aa21.41■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 IFNKQ9P0W0 207 aa21.41■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 MEGF6O75095 1541 aa21.41■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.41■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 TCIRG1Q13488 830 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 B4E1Z4 1266 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 ITGA6P23229 1130 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.39■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.39■■□□□ 1.02
LRP3-201ENST00000253193 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
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LRP3-201ENST00000253193 AIFM3Q96NN9 605 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 CFAP100Q494V2 611 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 PDILTQ8N807 584 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 GPR108Q9NPR9 543 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 SYKP43405 635 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 CASP7P55210 303 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 ADALQ6DHV7 355 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 OLFM4Q6UX06 510 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 JMYQ8N9B5 988 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 NAPBQ9H115 298 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.38■■□□□ 1.01
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LRP3-201ENST00000253193 ZNF202O95125 648 aa21.38■■□□□ 1.01
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LRP3-201ENST00000253193 CDKL5O76039 1030 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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LRP3-201ENST00000253193 ATL3Q6DD88 541 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 SMTNL1A8MU46 457 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 NEMFO60524 1076 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 ANO1Q5XXA6 986 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 TDO2P48775 406 aa21.36■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.36■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 KIF18AQ8NI77 898 aa21.36■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.36■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 ERICH2A1L162 156 aa21.36■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.36■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD7Q92527 254 aa21.36■■□□□ 1.01
LRP3-201ENST00000253193 GREM2Q9H772 168 aa21.36■■□□□ 1.01
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