RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227451.3

DTX4-201, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DTX4, Length 5,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4-201ENST00000227451 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.57■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 PHACTR2O75167 634 aa23.57■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 ASIC1P78348 528 aa23.57■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 PSMA7O14818 248 aa23.57■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.57■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.57■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 CCDC102AQ96A19 550 aa23.57■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.57■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.57■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 ALDH1B1P30837 517 aa23.56■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.56■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 USP25Q9UHP3 1055 aa23.56■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.56■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.56■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 LTKP29376 864 aa23.56■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 UVSSAQ2YD98 709 aa23.56■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 XAGE2Q96GT9 111 aa23.56■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 CCDC66A2RUB6 948 aa23.56■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 ISM2Q6H9L7 571 aa23.56■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 LPIN2Q92539 896 aa23.56■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.55■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 APOBRQ0VD83 1088 aa23.55■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 RUFY3Q7L099 469 aa23.55■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 URI1O94763 535 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.55■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.55■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 RLBP1P12271 317 aa23.55■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 CHMLP26374 656 aa23.55■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.55■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.55■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.54■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.54■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.54■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.54■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 UQCRHLA0A096LP55 91 aa23.54■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 F13A1P00488 732 aa23.54■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 UQCRHP07919 91 aa23.54■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 TAF3Q5VWG9 929 aa23.54■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 SMC5Q8IY18 1101 aa23.54■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 BRAPQ7Z569 592 aa23.54■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 SPAG5Q96R06 1193 aa23.54■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 TNNQ9UQP3 1299 aa23.54■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 FAM13AO94988 1023 aa23.53■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 DNA2P51530 1060 aa23.53■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 TIMM10P62072 90 aa23.53■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 SPTLC2O15270 562 aa23.53■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.53■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 SNX21Q969T3 373 aa23.53■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 TCHPQ9BT92 498 aa23.53■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 CHST3Q7LGC8 479 aa23.53■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 EHBP1Q8NDI1 1231 aa23.53■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.53■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 SYNCQ9H7C4 482 aa23.53■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 AOX1Q06278 1338 aa23.52■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 TNNT1P13805 278 aa23.52■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 USP19O94966 1318 aa23.52■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.52■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 TMEM87BQ96K49 555 aa23.52■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
DTX4-201ENST00000227451 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.51■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 AK2P54819 239 aa23.51■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 GCKRQ14397 625 aa23.51■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.51■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.51■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 APPBP2Q92624 585 aa23.51■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.51■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 PTPRTO14522 1441 aa23.51■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.51■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.51■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 NIM1KQ8IY84 436 aa23.5■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 DHX58Q96C10 678 aa23.5■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 AKR1B10O60218 316 aa23.5■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 CA8P35219 290 aa23.5■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.5■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 PLVAPQ9BX97 442 aa23.5■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.5■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 ARMT1Q9H993 441 aa23.5■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 GOPCQ9HD26 462 aa23.49■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 IFFO1Q0D2I5 559 aa23.49■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.49■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 MCM7P33993 719 aa23.49■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 HS2ST1Q7LGA3 356 aa23.49■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 BICDL2A1A5D9 508 aa23.48■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 MYZAPP0CAP1 466 aa23.48■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 ACTN2P35609 894 aa23.48■■□□□ 1.35
DTX4-201ENST00000227451 BACH1O14867 736 aa23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms