RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 RGL2O15211 777 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ZNF853P0CG23 659 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 UBA7P41226 1012 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 FEZ1Q99689 392 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 MYL1P05976 194 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CCDC181Q5TID7 509 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 FAM83GA6ND36 823 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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SETX-201ENST00000224140 TSPY8P0CW00 308 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ZNF76P36508 570 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 PTPN14Q15678 1187 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 COPRSQ9NQ92 184 aa7.25□□□□□ -1.25
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SETX-201ENST00000224140 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.25□□□□□ -1.25
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SETX-201ENST00000224140 CNPY4Q8N129 248 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 USP26Q9BXU7 913 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 YEATS4O95619 227 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 F13A1P00488 732 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NEFHP12036 1026 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 METP08581 1390 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 GCKRQ14397 625 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 RTN1Q16799 776 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 FBXW7Q969H0 707 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 MAGEF1Q9HAY2 307 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa7.25□□□□□ -1.25
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SETX-201ENST00000224140 C6orf50Q9HD87 102 aa7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
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SETX-201ENST00000224140 MON2Q7Z3U7 1717 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 RAD21O60216 631 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TOP1P11387 765 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.24□□□□□ -1.25
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SETX-201ENST00000224140 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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SETX-201ENST00000224140 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 WDR19Q8NEZ3 1342 aa7.24□□□□□ -1.25
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SETX-201ENST00000224140 HSPA4P34932 840 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 MYO5BQ9ULV0 1848 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 RPS6KB1P23443 525 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 FERMT2Q96AC1 680 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 MTX1Q13505 466 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.24□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.23□□□□□ -1.25
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SETX-201ENST00000224140 NUP58Q9BVL2 599 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ZNF445P59923 1031 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TCIRG1Q13488 830 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 C3P01024 1663 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 USP8P40818 1118 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NBPF14Q5TI25 921 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ALS2CR12Q96Q35 445 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 USP16Q9Y5T5 823 aa7.23□□□□□ -1.25
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