RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.58■■□□□ 1.85
ANKRD54-201ENST00000215941 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa26.58■■□□□ 1.85
ANKRD54-201ENST00000215941 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.58■■□□□ 1.85
ANKRD54-201ENST00000215941 NBPF11Q86T75 865 aa26.58■■□□□ 1.85
ANKRD54-201ENST00000215941 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.57■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.57■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.57■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 MYD88Q99836 296 aa26.57■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 GLI3P10071 1580 aa26.57■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.56■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 ELF2Q15723 593 aa26.56■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.56■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 KIAA1468Q9P260 1216 aa26.56■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 SPEF2Q9C093 1822 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 YEATS4O95619 227 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 EVCP57679 992 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 TFCP2Q12800 502 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC93Q567U6 631 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 SDF4Q9BRK5 362 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.54■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 PCDHA7Q9UN72 937 aa26.54■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.54■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.54■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 APOBRQ0VD83 1088 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 IGSF3O75054 1194 aa26.51■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.51■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 GPR108Q9NPR9 543 aa26.51■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 BRAPQ7Z569 592 aa26.51■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.51■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.51■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 IKBKBO14920 756 aa26.5■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NLRP12P59046 1061 aa26.5■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.5■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa26.5■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.5■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 E7EWF7 191 aa26.49■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 ARMCX5Q6P1M9 558 aa26.49■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.49■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 PAPPAQ13219 1627 aa26.49■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 MYO1BO43795 1136 aa26.48■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.48■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.48■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NDUFA8P51970 172 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 STK38Q15208 465 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 TMC6Q7Z403 805 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 BTG4Q9NY30 223 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 IFNKQ9P0W0 207 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 SMC2O95347 1197 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 CCT2P78371 535 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 DPCR1Q3MIW9 517 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 TIGD1Q96MW7 591 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 PAG1Q9NWQ8 432 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 V9GYY5 206 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NBPF26B4DH59 902 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 TPM1P09493 284 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NBPF14Q5TI25 921 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NBPF15Q8N660 670 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF446Q9NWS9 450 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NEDD4P46934 1319 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 ETF1P62495 437 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A1B0GVL5 298 aa26.45■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 SPTLC2O15270 562 aa26.45■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 CBFA2T2O43439 604 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP8B1O43520 1251 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 SYT10Q6XYQ8 523 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 CMA1P23946 247 aa26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms