RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.58■■□□□ 1.85
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ANKRD54-201ENST00000215941 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.58■■□□□ 1.85
ANKRD54-201ENST00000215941 NBPF11Q86T75 865 aa26.58■■□□□ 1.85
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ANKRD54-201ENST00000215941 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.57■■□□□ 1.84
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ANKRD54-201ENST00000215941 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.57■■□□□ 1.84
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ANKRD54-201ENST00000215941 GLI3P10071 1580 aa26.57■■□□□ 1.84
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ANKRD54-201ENST00000215941 ELF2Q15723 593 aa26.56■■□□□ 1.84
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ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.54■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.54■■□□□ 1.84
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ANKRD54-201ENST00000215941 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 IGSF3O75054 1194 aa26.51■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.51■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 GPR108Q9NPR9 543 aa26.51■■□□□ 1.84
ANKRD54-201ENST00000215941 BRAPQ7Z569 592 aa26.51■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.51■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.51■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 IKBKBO14920 756 aa26.5■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NLRP12P59046 1061 aa26.5■■□□□ 1.83
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ANKRD54-201ENST00000215941 ARMCX5Q6P1M9 558 aa26.49■■□□□ 1.83
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ANKRD54-201ENST00000215941 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.49■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 PAPPAQ13219 1627 aa26.49■■□□□ 1.83
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ANKRD54-201ENST00000215941 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
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ANKRD54-201ENST00000215941 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NDUFA8P51970 172 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 STK38Q15208 465 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 TMC6Q7Z403 805 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 BTG4Q9NY30 223 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 IFNKQ9P0W0 207 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 SMC2O95347 1197 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 CCT2P78371 535 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
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ANKRD54-201ENST00000215941 TIGD1Q96MW7 591 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 PAG1Q9NWQ8 432 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 V9GYY5 206 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NBPF26B4DH59 902 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 TPM1P09493 284 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NBPF14Q5TI25 921 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NBPF15Q8N660 670 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF446Q9NWS9 450 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 NEDD4P46934 1319 aa26.46■■□□□ 1.83
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ANKRD54-201ENST00000215941 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A1B0GVL5 298 aa26.45■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 SPTLC2O15270 562 aa26.45■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 CBFA2T2O43439 604 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP8B1O43520 1251 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 SYT10Q6XYQ8 523 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-201ENST00000215941 CMA1P23946 247 aa26.44■■□□□ 1.82
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