RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028748.12

Capn3-201, Transcript of Calpain-3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Capn3, Length 2,606 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3-201ENSMUST00000028748 RdxP26043 583 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Rad23bP54728 416 aa14.72□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Hirip3Q8BLH7 601 aa14.72□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 IarsQ8BU30 1262 aa14.72□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Add2Q9QYB8 725 aa14.72□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Lgr5Q9Z1P4 907 aa14.72□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Slc39a11Q8BWY7 342 aa14.72□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Nphp3Q7TNH6 1325 aa14.71□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Plcd3Q8K2J0 785 aa14.71□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Adarb2Q9JI20 745 aa14.71□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa14.71□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Kcnq2Q9Z351 759 aa14.71□□□□□ -0.05
Capn3-201ENSMUST00000028748 Magea1O89006 320 aa14.71□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Magea5O89009 320 aa14.71□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Magea2Q9R2A2 320 aa14.71□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Sh3bp5Q9Z131 463 aa14.71□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 1700029H14RikE9PY36 240 aa14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Magea6O89010 325 aa14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Hoxa7P02830 229 aa14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Ftl2P49945 183 aa14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Tyro3P55144 880 aa14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 IntuQ059U7 942 aa14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Ccdc66Q6NS45 935 aa14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Magea3Q6T340 320 aa14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Naa16Q9DBB4 864 aa14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Casz1Q9CWL2 1761 aa14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Nrbp1Q99J45 535 aa14.7□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Card6E9PWH2 1175 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Atp6v0a2P15920 856 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Rps8P62242 208 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Polr3gQ6NXY9 223 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 HlfQ8BW74 295 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Ttc27Q8CD92 847 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Aknad1E9Q8N6 675 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Eya2O08575 532 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Celf1P28659 486 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 EgfrQ01279 1210 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Slc38a10Q5I012 1090 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Atg9aQ68FE2 551 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Zkscan8Q8BSL0 588 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Brf1Q8CFK2 676 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Top1mtQ8R4U6 593 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Tmem143Q8VD26 458 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Taf1dQ9D4V4 322 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Ifi35Q9D8C4 286 aa14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Hmx1O70218 332 aa14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 NfixP70257 488 aa14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Zbtb45Q52KG4 520 aa14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Cdca7lQ922M5 438 aa14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Cdk4P30285 303 aa14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Timm10P62073 90 aa14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 EspnlQ3UYR4 1005 aa14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Znf496Q5SXI5 585 aa14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Nap1l3Q794H2 544 aa14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Q9D9S1 216 aa14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Plekho1Q9JIY0 408 aa14.68□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 CgnP59242 1191 aa14.67□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Ciapin1Q8WTY4 309 aa14.67□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Psd3Q2PFD7 1037 aa14.67□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Cnnm3Q32NY4 713 aa14.67□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 B4galnt4Q766D5 1034 aa14.67□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Ambra1A2AH22 1300 aa14.67□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 1700006A11RikB9EHI3 544 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Ell2Q3UKU1 639 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Leo1Q5XJE5 667 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Ifit2Q64112 472 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Ano6Q6P9J9 911 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Ccz1Q8C1Y8 480 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Tsr2Q8C8T8 191 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Cd248Q91V98 765 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Dydc2Q9D3X8 139 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Fam84aQ9D650 292 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Abcc4E9Q236 1325 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Casp1P29452 402 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Stac3Q8BZ71 360 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Tango6Q8C3S2 1079 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 TnmdQ9EP64 317 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Hmgn5Q9JL35 406 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Map3k15A2AQW0 1331 aa14.66□□□□□ -0.06
Capn3-201ENSMUST00000028748 Cfap70D3YVL2 1141 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.8 ms