RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	APLNR	P35414	380 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	BEND4	Q6ZU67	534 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SEC11C	Q9BY50	192 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	MLX	Q9UH92	298 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481		F8W036	122 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	KCNAB3	O43448	404 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	XRCC2	O43543	280 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	NGF	P01138	241 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	HEXA	P06865	529 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM157C	P0CG43	387 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	THBS4	P35443	961 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	RAB13	P51153	203 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	BLOC1S1	P78537	153 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM3A	P98173	230 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	LY6D	Q14210	128 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	PPA1	Q15181	289 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	TMED6	Q8WW62	240 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	RGCC	Q9H4X1	137 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	ADAP1	O75689	374 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	HOXC12	P31275	282 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	WNT5A	P41221	380 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	ALDH3B1	P43353	468 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	P2RY6	Q15077	328 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	WDR31	Q8NA23	367 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	POC1A	Q8NBT0	407 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SPSB4	Q96A44	273 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	BOD1	Q96IK1	185 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	CHST5	Q9GZS9	411 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	CAD	P27708	2225 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A0G2JNJ9	132 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SERPINE3	A8MV23	424 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	TAAR5	O14804	337 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	CA11	O75493	328 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	AGFG2	O95081	481 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SNAPIN	O95295	136 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	BMP5	P22003	454 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	ECI1	P42126	302 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	UBE2V2	Q15819	145 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	MST1L	Q2TV78	715 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	PP6455	Q8WZ26	134 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	OR51B6	Q9H340	312 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	TREM1	Q9NP99	234 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	COA4	Q9NYJ1	87 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	EHF	Q9NZC4	300 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481		Q9UFV3	132 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A1W2PP11	408 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	PTGFR	P43088	359 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	S100A12	P80511	92 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	RBPJ	Q06330	500 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	OR8B8	Q15620	311 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	C10orf35	Q96D05	121 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	PECR	Q9BY49	303 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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