RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	UCN3	Q969E3	161 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	COL21A1	Q96P44	957 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	COPS4	Q9BT78	406 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51I1	Q9H343	314 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MCUB	Q9NWR8	336 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GIN1	Q9NXP7	522 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ING4	Q9UNL4	249 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GVG6	124 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TLCD2	A6NGC4	264 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		B4DXG7	233 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CLDN34	H7C241	214 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FAAH	O00519	579 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FFAR1	O14842	300 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC22A1	O15245	554 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SGCE	O43556	437 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	AIFM1	O95831	613 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS1	P07477	247 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMB9	P28065	219 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	XK	P51811	444 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	EFNA3	P52797	238 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CRISP3	P54108	245 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35B1	P78383	322 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HPCA	P84074	193 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PITPNA	Q00169	270 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	AHSA2	Q719I0	299 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	STX19	Q8N4C7	294 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00471	Q8N535	108 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	NT5C	Q8TCD5	201 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SFXN5	Q8TD22	340 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	APH1B	Q8WW43	257 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	YIPF6	Q96EC8	236 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf85	Q96MD7	179 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		Q96MT0	163 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	AICDA	Q9GZX7	198 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	AMBN	Q9NP70	447 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CALML5	Q9NZT1	146 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNA1A	O00555	2505 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0J9YY10	115 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		D6RAR5	112 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR171	O14626	319 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CDK1	P06493	297 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF250	P15622	560 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	UGT2B7	P16662	529 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNGR2	P38484	337 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SERPINB10	P48595	397 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	DNASE1L1	P49184	302 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	B2M	P61769	119 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	LMO4	P61968	165 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CCL7	P80098	99 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TLE4	Q04727	773 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ST3GAL4	Q11206	333 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TAL2	Q16559	108 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CASP12	Q6UXS9	341 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	BORCS5	Q969J3	196 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF681	Q96N22	645 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2A5	Q96R48	311 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXC2	Q99958	501 aa		3.95	□□□□□ -1.78

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