RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635550.1

SEC24C-207, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC24C, Length 3,424 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-207ENST00000635550 CT55Q8WUE5 264 aa6.34□□□□□ -1.39
SEC24C-207ENST00000635550 TCEAL3Q969E4 200 aa6.34□□□□□ -1.39
SEC24C-207ENST00000635550 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SEC24C-207ENST00000635550 SPSB4Q96A44 273 aa6.34□□□□□ -1.39
SEC24C-207ENST00000635550 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.34□□□□□ -1.39
SEC24C-207ENST00000635550 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SEC24C-207ENST00000635550 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.34□□□□□ -1.39
SEC24C-207ENST00000635550 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SEC24C-207ENST00000635550 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SEC24C-207ENST00000635550 DNAJC13O75165 2243 aa6.34□□□□□ -1.39
SEC24C-207ENST00000635550 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 C5orf49A4QMS7 147 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 MPPED1O15442 326 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 TSPAN15O95858 294 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 HEXAP06865 529 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 P2RY1P47900 373 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 ZXDAP98168 799 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 PEA15Q15121 130 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 TGIF1Q15583 401 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 LGI3Q8N145 548 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 CLCC1Q96S66 551 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 LRFN1Q9P244 771 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.34□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 ST8SIA3O43173 380 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 GPR137BO60478 399 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 HERPUD1Q15011 391 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 TSC22D1Q15714 1073 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 EXTL1Q92935 676 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 IP6K3Q96PC2 410 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 SYT3Q9BQG1 590 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 GINS3Q9BRX5 216 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 NEURL1O76050 574 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 NXPH3O95157 252 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 CER1O95813 267 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 NGFP01138 241 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 SEC11BP0C7V7 166 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 GLP1RP43220 463 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 UCP3P55916 312 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 HERV-K104P61576 105 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 PRDX4Q13162 271 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 CALHM2Q9HA72 323 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.33□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 GLAP06280 429 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 DAOP14920 347 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 OMGP23515 440 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 CLINT1Q14677 625 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 SSPNQ14714 243 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 GUK1Q16774 197 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 GPR157Q5UAW9 335 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 GAPTQ8N292 157 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 ISOC2Q96AB3 205 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 BOD1Q96IK1 185 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 LILRA1O75019 489 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 PRH1P02810 166 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 SERPINA7P05543 415 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 CAMLGP49069 296 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 LHX2P50458 406 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 IL13RA2Q14627 380 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 IGFBP7Q16270 282 aa6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SEC24C-207ENST00000635550 AVPI1Q5T686 147 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms