RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 BNIP1Q12981 228 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB136Q30KP8 78 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 SSX6Q7RTT6 188 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 DRAM1Q8N682 238 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC54Q8NEL0 328 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8NFD4 153 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 OR9G1Q8NH87 305 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ASB9Q96DX5 294 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 HRASLS5Q96KN8 279 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 HMG20AQ9NP66 347 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa21.56■■□□□ 1.04
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CAPNS1-217ENST00000629983 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 UTF1Q5T230 341 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 CASC10Q5T4H9 136 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 STPG2Q8N412 459 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAAF1Q8NEP3 725 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 CANT1Q8WVQ1 401 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 PP6455Q8WZ26 134 aa21.56■■□□□ 1.04
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CAPNS1-217ENST00000629983 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A18PA6NE21 464 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A16PA6NEW6 464 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A12PA8MX19 464 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF16O43320 207 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-7P01780 117 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A15PP0C7V4 464 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A13PP0C7W8 464 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A14PP0C7W9 464 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A24PP0C7X0 464 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8U1Q8NH10 309 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087X0M5 115 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GX30 115 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC14L6B5MCN3 397 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 LY86O95711 162 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKACBP22694 351 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 GLP1RP43220 463 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 NXNL2Q5VZ03 156 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX38Q6PEX7 206 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 TCEANCQ8N8B7 351 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 LEAP2Q969E1 77 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf35Q96D05 121 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 COQ2Q96H96 371 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 NEK6Q9HC98 313 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 STAB2Q8WWQ8 2551 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL15A6NJ78 407 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1D-33P01593 117 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1-33P01594 117 aa21.53■■□□□ 1.04
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF20P17024 532 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 PDZK1IP1Q13113 114 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 LCNL1Q6ZST4 164 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC9Q8WXX5 260 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 DCLRE1BQ9H816 532 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6C3Q9NZP0 311 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 BIRC6Q9NR09 4857 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PPI3 338 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHG2P01859 326 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ATF1P18846 271 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 MADCAM1Q13477 382 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 LTC4SQ16873 150 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 C17orf58Q2M2W7 97 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 AADACL4Q5VUY2 407 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 RDH10Q8IZV5 341 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5D18Q8NGL1 313 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM163Q8TC26 289 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 NSL1Q96IY1 281 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-217ENST00000629983 KIRREL1Q96J84 757 aa21.52■■□□□ 1.04
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CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 J3QR06 171 aa21.51■■□□□ 1.03
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CAPNS1-217ENST00000629983 GNG10P50151 68 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 GID4Q8IVV7 300 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 IL4I1Q96RQ9 567 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 COMMD4Q9H0A8 199 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 PALMDQ9NP74 551 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 AP4M1O00189 453 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 APOL3O95236 402 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM107AO95990 144 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1D-12P01611 117 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 CSN2P05814 226 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 CHATP28329 748 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB7AP51149 207 aa21.5■■□□□ 1.03
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