RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 ACER2Q5QJU3 275 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 OR4S2Q8NH73 311 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 ZFP64Q9NPA5 681 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 SIRT7Q9NRC8 400 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 TRAV17A0A0B4J275 112 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 OR10AC1Q8NH08 325 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 WNK3Q9BYP7 1800 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 CIDEAO60543 219 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 CARFQ8N187 725 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 OR6C3Q9NZP0 311 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 TTRP02766 147 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 DAOP14920 347 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 SULT1A1P50225 295 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 ZNF260Q3ZCT1 412 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 LYRM7Q5U5X0 104 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 NAGKQ9UJ70 344 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 AMDHD2Q9Y303 409 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 F5H697 171 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 LSM6P62312 80 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 HYAL1Q12794 435 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 ELOBQ15370 118 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 OR10A7Q8NGE5 316 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 NUBPLQ8TB37 319 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 ADTRPQ96IZ2 230 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 DLEC1Q9Y238 1755 aa10.55□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 LIPT2A6NK58 231 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 MS4A18H0YCH9 400 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 SEMA7AO75326 666 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 PPOXP50336 477 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 MPV17LQ2QL34 196 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 MS4A18Q3C1V0 323 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 FAM74A3Q4VXF1 159 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 PET117Q6UWS5 81 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 GAPTQ8N292 157 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 ZNF383Q8NA42 475 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 CLEC5AQ9NY25 188 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 MFNGO00587 321 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 LYZL6O75951 148 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 ZNF250P15622 560 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 COL9A1P20849 921 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 FOXO1Q12778 655 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 COL19A1Q14993 1142 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 ZNF79Q15937 498 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 PTP4A1Q93096 173 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 PARP11Q9NR21 331 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 CCL27Q9Y4X3 112 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 C7orf77A4D0Y5 90 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 FAM87AP0C7U9 286 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 CD226Q15762 336 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 HFEQ30201 348 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 FOCADQ5VW36 1801 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 KIF13BQ9NQT8 1826 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 M0QZK8 103 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 GGCTO75223 188 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 COX19Q49B96 90 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 LILRA6Q6PI73 481 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 TMEM191AQ9H0A3 160 aa10.54□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 PDE6DO43924 150 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 ADAM11O75078 769 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 CTGFP29279 349 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 SNX22Q96L94 193 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 VSTM2LQ96N03 204 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 OR2T8A6NH00 312 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 HAND1O96004 215 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 OR10J1P30954 320 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 PMELP40967 661 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 DTD1Q8TEA8 209 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 H3BQ15 152 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 DRD3P35462 400 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 PRSS12P56730 875 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 TNXAQ16473 311 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 ASB5Q8WWX0 329 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 CCL17Q92583 94 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 GRAMD2BQ96HH9 432 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 FAM60AQ9NP50 221 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 C3orf80F5H4A9 247 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 PSG5Q15238 335 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 FDX2Q6P4F2 183 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 OR4P4Q8NGL7 312 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 NPAS1Q99742 590 aa10.53□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 CYR61O00622 381 aa10.52□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 ZNF253O75346 499 aa10.52□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 PPYP01298 95 aa10.52□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 IGHV3-13P01766 116 aa10.52□□□□□ -0.72
TNS1-220ENST00000611415 IGHV3-7P01780 117 aa10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms