RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598256.1

LTBP4-222, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-222	ENST00000598256	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	SDSL	Q96GA7	329 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	MED30	Q96HR3	178 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256		Q96MF0	132 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	OR8B2	Q96RD0	313 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	PPA2	Q9H2U2	334 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	IFT22	Q9H7X7	185 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256		A0A1B0GW55	424 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	RAB27B	O00194	218 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	NDUFB3	O43676	98 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	SELL	P14151	372 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	FUT3	P21217	361 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	CHAT	P28329	748 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	RAB39B	Q96DA2	213 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	CHST6	Q9GZX3	395 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	DUX4	Q9UBX2	424 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256		A0A0A6YYH2	397 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256		A6NJ64	397 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	PSPN	O60542	156 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF737	O75373	536 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	HEXA	P06865	529 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	CDK2	P24941	298 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	LMO1	P25800	156 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	GRK1	Q15835	563 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256		Q6ZTK2	550 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	DTX3	Q8N9I9	347 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	SNX22	Q96L94	193 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	PECR	Q9BY49	303 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM82	A0PJX8	343 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	UBE2QL1	A1L167	161 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	DVL1	O14640	695 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	IGHV2-5	P01817	119 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	TK1	P04183	234 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	NDUFB7	P17568	137 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	OR3A1	P47881	315 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	GNB2	P62879	340 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	MADCAM1	Q13477	382 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	EDDM3A	Q14507	147 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	ARL6IP1	Q15041	203 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	ESCO2	Q56NI9	601 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	BRICD5	Q6PL45	260 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	ST8SIA4	Q92187	359 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LTBP4-222	ENST00000598256	WDFY2	Q96P53	400 aa		13.24	□□□□□ -0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms