RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589055.3

TMEM259-206, Transcript of transmembrane protein 259, human

TSL 3

Gene TMEM259, Length 791 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-206	ENST00000589055	FBLN7	Q53RD9	439 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF691	Q5VV52	312 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055		Q6ZS46	218 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	C1QL4	Q86Z23	238 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	LYG1	Q8N1E2	194 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	MALSU1	Q96EH3	234 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	JAM3	Q9BX67	310 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	RAB18	Q9NP72	206 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ODAM	A1E959	279 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	LALBA	P00709	142 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	CD24	P25063	80 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	LMO1	P25800	156 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	KLHL22	Q53GT1	634 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SATL1	Q86VE3	508 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	CYGB	Q8WWM9	190 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	F2RL2	O00254	374 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	DEGS1	O15121	323 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	CSF1	P09603	554 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	RAB3A	P20336	220 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	OR3A4P	P47883	348 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	PIGY	Q3MUY2	71 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF529	Q6P280	563 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055		Q6ZTK2	550 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	STMN2	Q93045	179 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	OR5M11	Q96RB7	305 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	GPER1	Q99527	375 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055		H0YJX3	145 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	BLCAP	P62952	87 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CORO2A	Q92828	525 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	TMEM106A	Q96A25	262 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	RDH12	Q96NR8	316 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CDRT1	O95170	752 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	IGHV3-7	P01780	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	DCK	P27707	260 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	HTR1D	P28221	377 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	PTGFR	P43088	359 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	GLP1R	P43220	463 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	MTNR1B	P49286	362 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	RCN1	Q15293	331 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CHST4	Q8NCG5	386 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	GPR148	Q8TDV2	347 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CFHR4	Q92496	578 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	KIF25	Q9UIL4	384 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	FUOM	A2VDF0	154 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	HTR3B	O95264	441 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	IGLV1-47	P01700	117 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CSN2	P05814	226 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	GNAO1	P09471	354 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CD28	P10747	220 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	DYNLT3	P51808	116 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	DOC2B	Q14184	412 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CCDC58	Q4VC31	144 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	ELP2	Q6IA86	826 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055		Q8N2B8	174 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	PXT1	Q8NFP0	134 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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