RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CXXC4Q9H2H0 198 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GRPP07492 148 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GLRA1P23415 457 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LIN54Q6MZP7 749 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DHRS9Q9BPW9 319 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 WDR13Q9H1Z4 485 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LIME1Q9H400 295 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CHD6Q8TD26 2715 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZGRF1Q86YA3 2104 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IGSF10Q6WRI0 2623 aa22.45■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRAV24A0A0B4J272 114 aa22.45■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SFT2D2O95562 160 aa22.45■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CRYAAP02489 173 aa22.45■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 Q6ZR03 302 aa22.45■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SPERTQ8NA61 448 aa22.45■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 Q9N2K0 584 aa22.45■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SPEF1Q9Y4P9 236 aa22.45■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HSPB6O14558 160 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATP6V1G1O75348 118 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RBPJQ06330 500 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 Q6P435 159 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A1B0GWJ7 208 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C3orf80F5H4A9 247 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CLEC18BQ6UXF7 455 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ELOVL5Q9NYP7 299 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC23A1Q9UHI7 598 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PLSCR5A0PG75 271 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DBX1A6NMT0 343 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HS3ST1O14792 307 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DEGS1O15121 323 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BSNQ9UPA5 3926 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A0B4J2A0 478 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NXPH2O95156 264 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF44P15621 663 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCKARP32238 428 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KCTD9Q7L273 389 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 POC1AQ8NBT0 407 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RDH5Q92781 318 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TLNRD1Q9H1K6 362 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MSL2Q9HCI7 577 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SHPKQ9UHJ6 478 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCSO14618 274 aa22.42■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SNAPC5O75971 98 aa22.42■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CD8AP01732 235 aa22.42■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RPS2P15880 293 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FCGR2CP31995 323 aa22.42■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GLRXP35754 106 aa22.42■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GLP1RP43220 463 aa22.42■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MSMPQ1L6U9 139 aa22.42■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C11orf53Q8IXP5 236 aa22.42■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FXYD6Q9H0Q3 95 aa22.42■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa22.41■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF81P51508 661 aa22.41■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC9A3R2Q15599 337 aa22.41■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PCSK4Q6UW60 755 aa22.41■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HES4Q9HCC6 221 aa22.41■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 JKAMPQ9P055 326 aa22.41■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATRXP46100 2492 aa22.41■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KNG1P01042 644 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF728P0DKX0 622 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF250P15622 560 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KIR2DS4P43632 304 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KIR2DS1Q14954 304 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF146Q15072 292 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SPIN3Q5JUX0 258 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C22orf34Q6ZV56 151 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PDCD10Q9BUL8 212 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HMSDA8MTL9 139 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF205O95201 554 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OR2H2O95918 312 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MZT1Q08AG7 82 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 COQ8AQ8NI60 647 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MOB3AQ96BX8 217 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C16orf97H3BN30 126 aa22.39■■□□□ 1.17
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TSC22D2O75157 780 aa22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms