RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM172BPA6NC97 362 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OOSP1A8MZH6 123 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PTGES3LE9PB15 166 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 DLGAP1O14490 977 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CLN5O75503 358 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 DHRS3O75911 302 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CCNB2O95067 398 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV1-47P01700 117 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 MPZP25189 248 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PCP4P48539 62 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HMGA2P52926 109 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PSME3P61289 254 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 IL24Q13007 206 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 KIR2DS1Q14954 304 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 DEFB136Q30KP8 78 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TEX38Q6PEX7 206 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 STPG2Q8N412 459 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 RNF148Q8N7C7 305 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 RNF152Q8N8N0 203 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 AQP11Q8NBQ7 271 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 RFKQ969G6 155 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CEP19Q96LK0 163 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PKIBQ9C010 78 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 NUDT15Q9NV35 164 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM206AQ9NX38 181 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 GLS2Q9UI32 602 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 A4D1N5 150 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 F8VVB4 439 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 F8VWA3 439 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 MGST3O14880 152 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ATP5HO75947 161 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HAND1O96004 215 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV3-1P01715 115 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CDK2P24941 298 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HES1Q14469 280 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM42Q69YG0 159 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 RPEQ96AT9 228 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ISOC1Q96CN7 298 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 MROQ9BYG7 248 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 A6NIN4 97 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 LY6LH3BQJ8 138 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FGF16O43320 207 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 JTBO76095 146 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 IGHG2P01859 326 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 IGHA1P01876 353 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 GLAP06280 429 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ALOX5APP20292 161 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CD34P28906 385 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 INSL3P51460 131 aa7.15□□□□□ -1.26
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