RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-205ENST00000578348 STARD10Q9Y365 291 aa9.87□□□□□ -0.83
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GGA3-205ENST00000578348 M0R036 132 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-205ENST00000578348 SYNGR3O43761 229 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-205ENST00000578348 PRH1P02810 166 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-205ENST00000578348 DANCRP0C864 163 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-205ENST00000578348 PATE4P0C8F1 98 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-205ENST00000578348 PTAFRP25105 342 aa9.86□□□□□ -0.83
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GGA3-205ENST00000578348 PDCD1Q15116 288 aa9.86□□□□□ -0.83
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GGA3-205ENST00000578348 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.86□□□□□ -0.83
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GGA3-205ENST00000578348 IGKV1D-12P01611 117 aa9.85□□□□□ -0.83
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GGA3-205ENST00000578348 A6NLC8 198 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-205ENST00000578348 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-205ENST00000578348 ST8SIA3O43173 380 aa9.84□□□□□ -0.83
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GGA3-205ENST00000578348 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GGA3-205ENST00000578348 RNF212Q495C1 297 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-205ENST00000578348 GPR157Q5UAW9 335 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-205ENST00000578348 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
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