RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691		A0A0A6YYD4	124 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	CTDSP2	O14595	271 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	SOCS1	O15524	211 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	XRCC3	O43542	346 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	HPGDS	O60760	199 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	IGHV2-5	P01817	119 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	TK1	P04183	234 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	CSN2	P05814	226 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	CHAT	P28329	748 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM50B	P56557	158 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	LMO4	P61968	165 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	PAX5	Q02548	391 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691		Q6ZTK2	550 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691		Q96MF0	132 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	NICN1	Q9BSH3	213 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	REG4	Q9BYZ8	158 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM82	A0PJX8	343 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	FUOM	A2VDF0	154 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	SIRPB1	O00241	398 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	MGST3	O14880	152 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	PSPN	O60542	156 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	CA11	O75493	328 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	CLPX	O76031	633 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	ELK1	P19419	428 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	S100A5	P33763	92 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	TALDO1	P37837	337 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	PDCD1	Q15116	288 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	BIVM	Q86UB2	503 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	POM121C	A8CG34	1229 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	FAM25A	B3EWG3	89 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	FAM25C	B3EWG5	89 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	FAM25G	B3EWG6	89 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	DVL1	O14640	695 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	CDK2	P24941	298 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	OR3A1	P47881	315 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	GRK1	Q15835	563 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	ESCO2	Q56NI9	601 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	CD276	Q5ZPR3	534 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	WDFY2	Q96P53	400 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	CLN8	Q9UBY8	286 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	METRN	Q9UJH8	293 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691		A0A096LNT2	108 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	SERPINE3	A8MV23	424 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691		H7C1Q1	480 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	TFF1	P04155	84 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	GNB2	P62879	340 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	CDNF	Q49AH0	187 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	C1orf159	Q96HA4	380 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	PECR	Q9BY49	303 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TBCD-223	ENST00000576691	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TBCD-223	ENST00000576691		A8MXK9	166 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TBCD-223	ENST00000576691	FOXH1	O75593	365 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TBCD-223	ENST00000576691	MELTF	P08582	738 aa		13.95	□□□□□ -0.18

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