RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564131.1

RRN3-206, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 1,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-206ENST00000564131 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RRN3-206ENST00000564131 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.53□□□□□ -1.04
RRN3-206ENST00000564131 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RRN3-206ENST00000564131 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RRN3-206ENST00000564131 LYSTQ99698 3801 aa8.52□□□□□ -1.04
RRN3-206ENST00000564131 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 METTL15A6NJ78 407 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 SERPINE3A8MV23 424 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 CCL24O00175 119 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 KDM4BO94953 1096 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 OR2H2O95918 312 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 OR2T7P0C7T2 308 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 CGB3P0DN86 165 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 CGB7P0DN87 165 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 GLIPR1P48060 266 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 RAB7AP51149 207 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 MTCP1P56278 107 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 CBX1P83916 185 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 AESQ08117 197 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 EBI3Q14213 229 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 KIR2DS1Q14954 304 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 FAHD1Q6P587 224 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 TEX38Q6PEX7 206 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 SAXO1Q8IYX7 474 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 OR8H3Q8N146 312 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 TMEM163Q8TC26 289 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 TFAP2CQ92754 450 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 RPEQ96AT9 228 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 SPSB1Q96BD6 273 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 RAX2Q96IS3 184 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 ADI1Q9BV57 179 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 GON7Q9BXV9 100 aa8.52□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 A0A1W2PPI3 338 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 NUDT19A8MXV4 375 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 J3QR06 171 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 SIRPB1O00241 398 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 MT-ND2P03891 347 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 ISG15P05161 165 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 ATF1P18846 271 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 CALB2P22676 271 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 ISL1P61371 349 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 PAX5Q02548 391 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 CASC10Q5T4H9 136 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 SSX6Q7RTT6 188 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 GID4Q8IVV7 300 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 STPG2Q8N412 459 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 OR8U1Q8NH10 309 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 TOMM40LQ969M1 308 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 COQ2Q96H96 371 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 KIRREL1Q96J84 757 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 KRT84Q9NSB2 600 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 SCOCQ9UIL1 159 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.51□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 ZAR1LA6NP61 321 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 AP4M1O00189 453 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 INMTO95050 263 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 FAM107AO95990 144 aa8.5□□□□□ -1.05
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RRN3-206ENST00000564131 TMED1Q13445 227 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 MADCAM1Q13477 382 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 FHL3Q13643 280 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 ODF4Q2M2E3 257 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 TMEM244Q5VVB8 128 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 C12orf73Q69YU5 71 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 Q6P435 159 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 DRAM1Q8N682 238 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.5□□□□□ -1.05
RRN3-206ENST00000564131 OR56B4Q8NH76 319 aa8.5□□□□□ -1.05
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