RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		17.58	■□□□□ 0.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	17.57	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF44	P15621	663 aa		17.57	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB13	P51153	203 aa		17.57	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	EFNB2	P52799	333 aa		17.57	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		17.57	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	17.57	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	GGH	Q92820	318 aa		17.57	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM80	Q96HE8	168 aa		17.57	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		17.57	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	TCF19	Q9Y242	345 aa		17.57	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		17.57	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	FUOM	A2VDF0	154 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMM23	O14925	209 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	DEGS1	O15121	323 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDOB	P05062	364 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CD2	P06729	351 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	GNAO1	P09471	354 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	MYL12A	P19105	171 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	DYNLT3	P51808	116 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	SCN1B	Q07699	218 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA1A	Q53H76	456 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52N1	Q8NH53	320 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		17.56	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ODAM	A1E959	279 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM189A2	Q15884	450 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200		A6NDX4	124 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200		M0QZ24	198 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEB3	O15480	346 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CDK2	P24941	298 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	GDNF	P39905	211 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPG	P40121	348 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ST3GAL4	Q11206	333 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	GHSR	Q92847	366 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	GPER1	Q99527	375 aa		17.55	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200		H0YJX3	145 aa		17.54	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	17.54	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf88	Q6PI97	169 aa		17.54	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	SATL1	Q86VE3	508 aa		17.54	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		17.54	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		17.54	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	17.54	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		17.54	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	17.54	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		17.54	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		17.54	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV1-47	P01700	117 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CGB3	P0DN86	165 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CGB7	P0DN87	165 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CD34	P28906	385 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGFR	P43088	359 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	OR3A4P	P47883	348 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	PAX5	Q02548	391 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	IL13RA2	Q14627	380 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52W1	Q6IF63	320 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8N2B8	174 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ORAI1	Q96D31	301 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		17.53	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087X0M5	115 aa		17.52	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GX30	115 aa		17.52	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		17.52	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		17.52	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	WIPF1	O43516	503 aa		17.52	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	XPNPEP2	O43895	674 aa		17.52	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	GPX5	O75715	221 aa		17.52	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	BDH1	Q02338	343 aa		17.52	■□□□□ 0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	MED21	Q13503	144 aa		17.52	■□□□□ 0.4

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