RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558639.5

PSMA4-208, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 3

Gene PSMA4, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-208	ENST00000558639	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF879	B4DU55	563 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639		F5H5P2	479 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	CCRL2	O00421	344 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	MAGEB3	O15480	346 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	SYT7	O43581	403 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	HLA-DPB1	P04440	258 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ISG15	P05161	165 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	KITLG	P21583	273 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	PSMB9	P28065	219 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	HCCS	P53701	268 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	PAX8	Q06710	450 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	CDK5R1	Q15078	307 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	FAM201A	Q5SY85	155 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	SPERT	Q8NA61	448 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OR8G5	Q8NG78	346 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	GPR148	Q8TDV2	347 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	REEP6	Q96HR9	211 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	MGLL	Q99685	303 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	FAM206A	Q9NX38	181 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	MIOX	Q9UGB7	285 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	OGG1	O15527	345 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	DHRS3	O75911	302 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	ARL6IP5	O75915	188 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	CEL	P19835	753 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	GAL	P22466	123 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	GABRA5	P31644	462 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	PPP3R1	P63098	170 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	DEFA6	Q01524	100 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	IRF3	Q14653	427 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	C16orf87	Q6PH81	154 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	SSX6	Q7RTT6	188 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	GPR141	Q7Z602	305 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	NAA40	Q86UY6	237 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	PP6455	Q8WZ26	134 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	RNF183	Q96D59	192 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	OR8B2	Q96RD0	313 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	CLN8	Q9UBY8	286 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	SSR3	Q9UNL2	185 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639		A8MXK9	166 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	IFNL4	K9M1U5	179 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	HSPB6	O14558	160 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	LDLRAD4	O15165	306 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	CYB5A	P00167	134 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC2A1	P11166	492 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	MYL9	P24844	172 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	TNFSF8	P32971	234 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	PSMB10	P40306	273 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	PITPNB	P48739	271 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSMA4-208	ENST00000558639	PSMD7	P51665	324 aa		6.2	□□□□□ -1.42

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