RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558469.5

CUX1-216, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene CUX1, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-216ENST00000558469 FOXC2Q99958 501 aa8.01□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 CHST6Q9GZX3 395 aa8.01□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 DNTTIP1Q9H147 329 aa8.01□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.01□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 IFT22Q9H7X7 185 aa8.01□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 DIABLOQ9NR28 239 aa8.01□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.01□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.01□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.01□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 A3GALT2U3KPV4 340 aa8.01□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 UBE2QL1A1L167 161 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 RAB27BO00194 218 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 SIGLEC5O15389 551 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 PSPNO60542 156 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 PDCD6O75340 191 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 CLPXO76031 633 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 SCGNO76038 276 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 WNT2P09544 360 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 SELLP14151 372 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 SLC25A16P16260 332 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 CHATP28329 748 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 TNFSF8P32971 234 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 S100A5P33763 92 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 TMEM50BP56557 158 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 MADCAM1Q13477 382 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 SHEQ5VZ18 495 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 C17orf107Q6ZR85 190 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 IZUMO1Q8IYV9 350 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 TMEM185AQ8NFB2 350 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 CLDND2Q8NHS1 167 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 NEK7Q8TDX7 302 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 RAB3CQ96E17 227 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 CYYR1Q96J86 154 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 SNX22Q96L94 193 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 Q96MF0 132 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 FAAP24Q9BTP7 215 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 PECRQ9BY49 303 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 SHARPINQ9H0F6 387 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 PPA2Q9H2U2 334 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 SPACA1Q9HBV2 294 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 PTTG2Q9NZH5 202 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 KAAG1Q9UBP8 84 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 CTSZQ9UBR2 303 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 ADAM30Q9UKF2 790 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 MAB21L2Q9Y586 359 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 A0A0A6YYH2 397 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 TMEM82A0PJX8 343 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 A6NJ64 397 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 H3BUI4 141 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 K7N7A8 449 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 DVL1O14640 695 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 XRCC3O43542 346 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 NDUFB3O43676 98 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 ZNF737O75373 536 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 FCN3O75636 299 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 IGHV2-5P01817 119 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 TK1P04183 234 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 GNB3P16520 340 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 NDUFB7P17568 137 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 TALDO1P37837 337 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 OR3A1P47881 315 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 LMO4P61968 165 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 GRK1Q15835 563 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 CDNFQ49AH0 187 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 CNIH2Q6PI25 160 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 FGFRL1Q8N441 504 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 ST8SIA4Q92187 359 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 OR8B2Q96RD0 313 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-216ENST00000558469 ING3Q9NXR8 418 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms