RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 REG4Q9BYZ8 158 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 MMP27Q9H306 513 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 BANF2Q9H503 90 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 CACNG2Q9Y698 323 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 hADV38S2A0JD32 116 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 B4DSR2 109 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 RNF223E7ERA6 249 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 SIRPB1O00241 398 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 MGST3O14880 152 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 WNT9BO14905 357 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 SIGLEC5O15389 551 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 PDCD6O75340 191 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 APOA1P02647 267 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 SFTPBP07988 381 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 CD3GP09693 182 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 VSIG8P0DPA2 414 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 PSG2P11465 335 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 GATA3P23771 443 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 VEGFCP49767 419 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 CLDN12P56749 244 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 EDDM3BP56851 147 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 GNG2P59768 71 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 ERVK11-1P61568 191 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 COL10A1Q03692 680 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 SCGB2A2Q13296 93 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 ARFRP1Q13795 201 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 TAF9Q16594 264 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 TMEM69Q5SWH9 247 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 STUMQ69YW2 141 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 BATF2Q8N1L9 274 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 OR5T2Q8NGG2 359 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 CCL13Q99616 98 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 TMEM165Q9HC07 324 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 HES4Q9HCC6 221 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 A3GALT2U3KPV4 340 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 SERPINE3A8MV23 424 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 CD5LO43866 347 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 OR2H2O95918 312 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 HNF1AP20823 631 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 DUSP1P28562 367 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 PMELP40967 661 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 INPP1P49441 399 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 CAV3P56539 151 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 PIGYQ3MUY2 71 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 C6orf183Q5T699 404 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 ASPHD2Q6ICH7 369 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 GLCCI1Q86VQ1 547 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 OR8H2Q8N162 312 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 Q8NFD4 153 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 SDSLQ96GA7 329 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 Q96M66 194 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 TM2D1Q9BX74 207 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 IFT22Q9H7X7 185 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 ETAA1Q9NY74 926 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 A0A075B6Q4 140 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 A0A0G2JMP0 313 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 A0A0X1KG70 313 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 POM121CA8CG34 1229 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 K7N7A8 449 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 HSPB6O14558 160 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-218ENST00000550159 DVL1O14640 695 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms