RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SPHARQ15513 63 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 MED22Q15528 200 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ZNF561Q8N587 486 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 LHX4Q969G2 390 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TBX15Q96SF7 602 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 GPER1Q99527 375 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 MND1Q9BWT6 205 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SIRPDQ9H106 197 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 DUSP21Q9H596 190 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 RGS10O43665 173 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TK1P04183 234 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 CHRM2P08172 466 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 HSMCR30P0CW71 290 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TGFBR2P37173 567 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 MAP2K4P45985 399 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ZP1P60852 638 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PPP3R1P63098 170 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SCN1BQ07699 218 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 IRF3Q14653 427 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PDCD1Q15116 288 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 Q499Y3 187 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 RNLSQ5VYX0 342 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ZNF529Q6P280 563 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 DUX5Q96PT3 197 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 OR14A2Q96R54 314 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 HMG20AQ9NP66 347 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PRD5 423 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PRF3 423 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PRM7 423 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TMEM82A0PJX8 343 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 K7N7A8 449 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 GABRPO00591 440 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SH2D1BO14796 132 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 PIN1P1O15428 100 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 KDM4BO94953 1096 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 CDRT1O95170 752 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 HAND1O96004 215 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MAS1P04201 325 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ALDOBP05062 364 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 GABRR1P24046 479 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 BDKRB2P30411 391 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ERVFRD-1P60508 538 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ACSM1Q08AH1 577 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 INSL4Q14641 139 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 DDI2Q5TDH0 399 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 GPR157Q5UAW9 335 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 Q8IYB0 196 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 Q8N7P7 452 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TMED9Q9BVK6 235 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 CHST6Q9GZX3 395 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 NOX4Q9NPH5 578 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 GLS2Q9UI32 602 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ING4Q9UNL4 249 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 KPTNQ9Y664 436 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SIRPB1O00241 398 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 PSPNO60542 156 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ZNF737O75373 536 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 CD1AP06126 327 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 CCL3L1P16619 93 aa7.88□□□□□ -1.15
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