RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.76□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.76□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 NRBF2Q96F24 287 aa6.76□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 RCHY1Q96PM5 261 aa6.76□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ZNF649Q9BS31 505 aa6.76□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CHST6Q9GZX3 395 aa6.76□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 NEK6Q9HC98 313 aa6.76□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 KRT84Q9NSB2 600 aa6.76□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 METTL15A6NJ78 407 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 NUDT19A8MXV4 375 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 F8VVB4 439 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 F8VWA3 439 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 SIRPB1O00241 398 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 PRKYO43930 277 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 IGHA1P01876 353 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 FAM106CPP0CH98 169 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ZNF20P17024 532 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CCL1P22362 96 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 PRKACBP22694 351 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CDK2P24941 298 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CD24P25063 80 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 DUSP1P28562 367 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 MTCP1P56278 107 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 P2RX3P56373 397 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CDC42P60953 191 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 BDH1Q02338 343 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 SCN1BQ07699 218 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 UBE2V2Q15819 145 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 TMEM163Q8TC26 289 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 PP6455Q8WZ26 134 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 C10orf35Q96D05 121 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CITED4Q96RK1 184 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 TBX5Q99593 518 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.75□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 A0A087WXM4 84 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 PSMB11A5LHX3 300 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 OOSP1A8MZH6 123 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 SULT1C4O75897 302 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 OR2T7P0C7T2 308 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 BCL3P20749 454 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 SLC35B1P78383 322 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ZNF91Q05481 1191 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ZNF146Q15072 292 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 Q6ZSR3 168 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CNBD2Q96M20 576 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CHST5Q9GZS9 411 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.74□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 FAM172BPA6NC97 362 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CCDC160A6NGH7 325 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 PSPNO60542 156 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ENTPD6O75354 484 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 MMP23AO75900 390 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CALCBP10092 127 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ZNF44P15621 663 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ATF1P18846 271 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 NFYBP25208 207 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 SLC6A1P30531 599 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 PTGFRP43088 359 aa6.73□□□□□ -1.33
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